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J-GLOBAL ID：201402234720286826   整理番号：13A1207493

GenBankデータベースで預けられる微生物リボソームDNAシーケンスの正確さの研究

Study on the Accuracy of Microbial rDNA Sequences Deposited in GenBank Database

著者 (5件)： Chen Yuanyuan (The Key Lab. of Industrial Biotechnology,Ministry of Education,Jiangnan Univ., Wuxi) ,  Shen Wei (The Key Lab. of Industrial Biotechnology,Ministry of Education,Jiangnan Univ., Wuxi) ,  Fan You (The Key Lab. of Industrial Biotechnology,Ministry of Education,Jiangnan Univ., Wuxi) ,  Shi Guiyang (The Key Lab. of Industrial Biotechnology,Ministry of Education,Jiangnan Univ., Wuxi) ,  Wang Zhengxiang (The Key Lab. of Industrial Biotechnology,Ministry of Education,Jiangnan Univ., Wuxi)
資料名： Shipin yu Fajiao Gongye  (Shipin yu Fajiao Gongye)
巻： 38  号： 3  ページ： 28-31  発行年： 2012年 
JST資料番号： C2153A  ISSN： 0253-990X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： リボソームDNAシーケンス・ベースの分析法は,微生物識別において広く使われていた。この研究は,データがGenBankに預けたリボソームDNAシーケンスの正確さを確かめた。バシラスhorikoshiiの43個の16 SリボソームDNAシーケンス,アスペルギルスfoetidusの22個のITS(内部の転写スペーサー)シーケンスとカンジダboidiniiの23の26 sリボソームDNA D1/D2地域シーケンスは,GenBankデータベースから獲得された。結果はこれらの88の名をつけられたシーケンスから,5つが誤認されたか,信頼性がないことを示した。17は不完全で整列させるには短すぎ,58は未公開で,62は一般のコレクションの中で実証されていない。この研究は,GenBankデータベースが微生物リボソームDNA相同で限定的な基準値を提供したことを示唆する。関連したシーケンスの正確さは,BLAST分析によって確かめる必要がある。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  *データベース ,  古細菌 ,  精度 ,  Aspergillus ,  Candida ,  Candida boidinii ,  データ検索システム
準シソーラス用語： Aspergillus foetidus ,  BLAST ,  *DNAシークエンシング ,  Pyrococcus horikoshii ,  *リボソームDNA ,  *遺伝子データベース ,  正確さ ,  *微生物遺伝学

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物学(ウイルス以外)一般  (EG03010C)

タイトルに関連する用語 (7件)： GenBank ,  データベース ,  微生物 ,  リボソームDNA ,  シーケンス ,  正確さ ,  研究