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J-GLOBAL ID：201402258423945493   整理番号：14A0783668

Minfi Infinium DNAメチル化マイクロアレイの解析のための適応性のある総合的なBioconductorパッケージ

Minfi: a flexible and comprehensive Bioconductor package for the analysis of Infinium DNA methylation microarrays

著者 (8件)： ARYEE Martin J. (Harvard Medical School, MA, USA) ,  JAFFE Andrew E. (Johns Hopkins School of Public Health, MD, USA) ,  JAFFE Andrew E. (Lieber Inst. Brain Dev., MD, USA) ,  CORRADA-BRAVO Hector (Univ. Maryland, MD, USA) ,  LADD-ACOSTA Christine (Johns Hopkins School of Public Health, MD, USA) ,  FEINBERG Andrew P. (Johns Hopkins School of Public Health, MD, USA) ,  HANSEN Kasper D. (Johns Hopkins School of Public Health, MD, USA) ,  IRIZARRY Rafael A. (Johns Hopkins School of Public Health, MD, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 30  号： 10  ページ： 1363-1369  発行年： 2014年05月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Illumina Infinium DNAメチル化アレイの解析のためのソフトウエアパッケージMinfiについて示した。Minfiは,将来のDNAメチル化データ解析技術にも容易に適合できるようにデザインされ,キロベースからメガベースのスケールのメチル化領域の前処理,品質評価および検出のための方法により構築される。Minfiにより,バンプ検索およびブロック検索の両方が可能となり,同定された領域の統計的有意さを評価できることが示された。MinfiはBioconductorツールで実行されるため,Rで利用可能な数多くの解析ツールおよび可視化ツールにアクセス可能である。Minfiはウエブサイトで入手および実行可能である。

シソーラス用語： メチル化 ,  *DNAマイクロアレイ ,  プログラムパッケージ ,  データ検索 ,  可視化 ,  評価
準シソーラス用語： *DNAメチル化 ,  Minfi ,  ソフトウェアパッケージ ,  品質評価

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： DNAメチル化 ,  マイクロアレイ ,  解析 ,  適応性 ,  総合 ,  パッケージ