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J-GLOBAL ID:201402274458982745   整理番号:13A1534636

40の中心的な単純な配列反復(SSR)によって明らかにされた重要な中国のトウモロコシ近交系の遺伝的多様性と集団の構造

Genetic Diversity and Population Structure of Important Chinese Maize Inbred Lines Revealed by 40 Core Simple Sequence Repeats (SSRs)
著者 (13件):
資料名:
巻: 45  号: 11  ページ: 2107-2138  発行年: 2012年 
JST資料番号: W1459A  ISSN: 0578-1752  CODEN: CKNYAR  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 中国語 (ZH)
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目的:代表的な継承の遺伝子的な評価,すなわち多様性と集団構造は,これらの生殖質,対立遺伝子マイニング,共同マッピングの分析の利用において非常に重要である。方法:中国のトウモロコシの種類のフィンガープリントと均一性分析のために開発され,全てのトウモロコシ・ゲノムをカバーした40の中心的なSSRは,蛍光塩基配列決定法に基づく遺伝子タイピング技術によって,中国全域で820のトウモロコシ近交系の全セットのゲノム・スキャニングのために用いられた。これらの近交系の遺伝的多様性はソフトウェアPowerMarker V3.25を通して実行された。そして,これらの材料の集団の構造はStructureV2.3.3によって明らかにされた。結果:40のSSRの間で,これらの820の近交系の対立遺伝子のNo.は平均36.87で,10から72の範囲で,遺伝子多様性は平均0.8430で,0.46から0.9458の範囲で,PICは平均0.83で,0.43から0.94の範囲だった。モデル・ベースの方法に基づくクラスター形成分析からの結果は,これらの820の分析が5つのグループに分けられ,Lancaster,Luda red cob(LRC),Tang si ping tou(TSPT),Reid(PA and BSSS),Pグループ(またはPB)を含んだ。これらの5つのグループの遺伝子座当たりの相応する平均的対立遺伝子no.は,24.23,22,11.8,17.45,14.65であった。そして,遺伝子多様性はそれぞれ0.8145,0.8398,0.7054,0.7686,0.7495であった。結論:中心的なSSRによって明らかにされた結果は,比較的より高い大量の遺伝的変異と遺伝子多様性の予想以上に高いレベルを示した。5つのグループの間に有意差が存在した。ランカスターとLRCの多様性レベルは,Reid,TSPT,Pのものより統計学的に高かった。そして,TSPTとPのグループは,比較的低い遺伝的多様性を有した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST
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分類 (2件):
分類
JSTが定めた文献の分類名称とコードです
トウモロコシ  ,  集団遺伝学 

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