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J-GLOBAL ID：201402275043578678   整理番号：14A0402134

プロモーターレベルでの哺乳類発現アトラス

A promoter-level mammalian expression atlas

著者 (40件)： FORREST Alistair R. R. (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KAWAJI Hideya (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  DE HOON Michiel J. L. (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  LASSMANN Timo (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  LIZIO Marina (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  ITOH Masayoshi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  BERTIN Nicolas (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  ARNER Erik (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  PLESSY Charles (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  VITEZIC Morana (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  SEVERIN Jessica (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  ISHIZU Yuri (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  ARAKAWA Takahiro (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  BONETTI Alessandro (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  BURROUGHS A. Maxwell (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  FUKUDA Shiro (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  FURUNO Masaaki (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  HARBERS Matthias (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  HARSHBARGER Jayson (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  HASEGAWA Akira (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  HASEGAWA Yuki (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  HASHIMOTO Takehiro (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  HORI Fumi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KACZKOWSKI Bogumil (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KAIDA Kaoru (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KAIHO Ai (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KAJIYAMA Kazuhiro (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KANAMORI-KATAYAMA Mutsumi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KATAYAMA Shintaro (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KATO Sachi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KAWASHIMA Tsugumi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KOJIMA Miki (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KONDO Naoto (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KUBOSAKI Atsutaka (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  KWON Andrew T. (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  MANABE Ri-ichiroh (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  MOTAKIS Efthymios (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  MURATA Mitsuyoshi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  NAGAO-SATO Sayaka (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN) ,  NAKAZATO Kenichi (RIKEN Omics Sci. Center (OSC), Yokohama, JPN)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 507  号： 7493  ページ： 462-470  発行年： 2014年03月27日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 哺乳類の個体を構成する数百種類の細胞の多様性,発生経路および空間的構成は,転写の調節によって制御される。本論文では,1分子レベルでのcDNA塩基配列解読(1分子CAGEシーケンス)を用いて,ヒトおよびマウスの初代培養細胞,細胞株および組織において転写開始部位(TSS)およびその発現量をマップし,ヒトの体全体にわたる哺乳類遺伝子発現についての系統的な地図を作製した。この中で,真に「ハウスキーピング」に関わっている遺伝子はわずかである一方,多くの哺乳類のプロモーターは,独立した細胞種特異的発現プロファイルを持つ数個の近接した個別のTSSで構成される複合的な領域であることを見いだした。細胞種特異的なTSSはおのおの異なる速度で進化しているが,一方,広範な組織で発現している遺伝子のプロモーターは高度に保存されている。プロモーターに基づく発現解析は,細胞の状態を規定する主要な転写因子を明らかにし,それらの転写因子と結合部位モチーフを関連付けている。同定された新規転写産物の機能は,共発現解析およびオントロジーエンリッチメント解析により予測できる。FANTOM5(functional annotation of the mammalian genome 5)プロジェクトが示した哺乳類の細胞種特異的なトランスクリプトームの包括的な発現プロファイルおよび機能アノテーションは,生物医学研究に広範囲に応用可能である。Copyright Nature Publishing Group 2014

シソーラス用語： *哺乳類 ,  *遺伝子発現 ,  *培養細胞 ,  *遺伝子地図 ,  転写【遺伝】 ,  cDNA ,  ヌクレオチド配列 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  プロモーター領域 ,  転写因子 ,  オントロジー ,  ヒト ,  マウス ,  組織特異的発現 ,  転写開始部位 ,  転写産物 ,  配列解析 ,  *脊椎動物 ,  *分子遺伝現象 ,  ネズミ亜目

分類 (3件)： 動物生理一般  (EJ02010E) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

タイトルに関連する用語 (4件)： プロモーター ,  哺乳類 ,  発現 ,  アトラス