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J-GLOBAL ID：201402278091814552   整理番号：14A0285743

過冷却ST2水における液液相転移:アンブレラサンプリングと十分強化されたメタ動力学間の比較

The liquid-liquid transition in supercooled ST2 water: a comparison between umbrella sampling and well-tempered metadynamics

著者 (3件)： PALMER Jeremy C. (Princeton Univ., NJ, USA) ,  CAR Roberto (Princeton Univ., NJ, USA) ,  DEBENEDETTI Pablo G. (Princeton Univ., NJ, USA)
資料名： Faraday Discussions  (Faraday Discussions)
巻： 167  ページ： 77-94  発行年： 2013年 
JST資料番号： C0377A  ISSN： 1359-6640  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Parrinelloらの十分強化されたメタ動力学(WT-MetaD)技法を用い,自由エネルギー解析を通してST2水モデルの低温相挙動を調べた。技法は氷核形成,固/固相転移及び蛋白質折畳みを含む現象を調べるため成功裡に適用できた。幾つかの研究はWT-MetaDがアンブレラサンプリング(US)よりも効率的で自由エネルギー計算する必要計算時間を縮減する一方,匹敵する正確性を提供することを示した。WT-MetaDとUSの直接比較はこれらの知見が水モデルにおける液体/液体共存を調べるため一般化できるかどうかを調べた。Liuら及びPoolらと一致して,両方法から自由エネルギー計算が共存系で二種類の明確液相を示した。著者らの結果はWT-MetaDが有望アプローチであるが,液/液相転移を調べることに方法を適用する上で幾つかの課題を同定した。この課題をWT-MetaDの性能を改良できる最新方法論の革新と一緒に詳細に考察した。

シソーラス用語： 過冷却 ,  *過冷却液体 ,  *水モデル ,  標本抽出 ,  計算機シミュレーション ,  準安定状態 ,  挙動 ,  *相平衡 ,  ポテンシャルエネルギー面 ,  液相 ,  モンテカルロ法 ,  因果律 ,  スケーリング【計数】 ,  サイズ効果 ,  *自由エネルギー ,  遷移状態 ,  スケール則 ,  *第一種相転移 ,  臨界点 ,  秩序パラメータ ,  相変態 ,  氷晶核 ,  核形成 ,  エネルギー計算 ,  性質 ,  CPU時間 ,  汎化 ,  方法論
準シソーラス用語： アンブレラサンプリング ,  エネルギー障壁 ,  モンテカルロシミュレーション ,  因果関係 ,  液液相転移 ,  過冷却水 ,  相挙動 ,  動力学シミュレーション ,  有限サイズスケーリング ,  固相転移 ,  氷核 ,  蛋白質折畳み ,  自由エネルギー計算 ,  正確性 ,  計算時間 ,  一般化

分類 (1件)： 一成分系の相平衡・状態図  (CB03013K)

タイトルに関連する用語 (6件)： 過冷却 ,  ST2 ,  液液相転移 ,  アンブレラサンプリング ,  強化 ,  動力学