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J-GLOBAL ID：201402286004097575   整理番号：14A1340141

jvenn: インタラクティブVennダイアグラムビュア

jvenn: an interactive Venn diagram viewer

著者 (5件)： BARDOU Philippe (INRA, Castanet-Tolosan, FRA) ,  MARIETTE Jerome (INRA, Castanet-Tolosan, FRA) ,  ESCUDIE Frederic (INRA, Castanet-Tolosan, FRA) ,  DJEMIEL Christophe (INRA, Castanet-Tolosan, FRA) ,  KLOPP Christophe (INRA, Castanet-Tolosan, FRA)
資料名： BMC Bioinformatics (Web)  (BMC Bioinformatics (Web))
巻： 15  号： Aug  ページ： 15:293 (WEB ONLY)  発行年： 2014年08月 
JST資料番号： U7025A  ISSN： 1471-2105  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:Vennダイアグラムはリスト比較の表示に一般に用いられている。生物学では,異なる差次的分析に由来する遺伝子リスト間の違いを示すために広く用いられ,異なる実験条件あるいは異なる手法間の比較を可能にする。しかしながら,入力リスト数が4以上の場合,ダイアグラム解読が困難となる。代替レイアウトと動的ディスプレイがその利用と解読性を改善する。結果:新規JavaScriptライブラリーである。本ライブラリーはリストを処理してVennダイアグラムを作成する。最高6つ以上の入力リストを操作し,古典的またはEdwards-Vennレイアウトを用いて結果を表示する。ユーザインタラクションは制御およびカスタマイズが可能である。最終的に,jvennはウェブページに容易に組込まれ,動的Vennダイアグラム利用を可能とする。結論:jvennは科学者のデータ分析を援助するウェブ環境におけるオープンソースコンポーネントである。完全ドキュメンテーションと例から構成される本ライブラリパッケージはhttp://bioinfo.genotoul.fr/jvennから無料入手可能である。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： 計算機システム ,  ユーザインタフェイス ,  人間機械系 ,  ライブラリ【計算機】 ,  図表 ,  集合論 ,  プログラムパッケージ ,  遺伝学実験技術 ,  *RNA【核酸】 ,  *ヌクレオチド配列 ,  遺伝子発現 ,  データ処理
準シソーラス用語： jvenn ,  RNA配列解析 ,  Vennダイアグラム ,  インタラクティブグラフィックシステム ,  オープンソースコンピュータバージョンライブラリ ,  ユーザインタラクション

分類 (2件)： 遺伝子操作  (EC02050B) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)