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J-GLOBAL ID：201402286692041391   整理番号：14A1231890

実験家系におけるDNAマーカーを用いた近交度のばらつき

Variance of Inbreeding Values Calculated from Marker Genotypes in a Simple Experimental Family

著者 (3件)： 小林栄治 (農業・食品産業技術総合研究機構 畜産草地研) ,  西尾元秀 (農業・食品産業技術総合研究機構 畜産草地研) ,  古川力 (東京農大)
資料名： 日本養豚学会誌  (Japanese Journal of Swine Science)
巻： 51  号： 3  ページ： 143-151  発行年： 2014年09月30日 
JST資料番号： Y0196A  ISSN： 0913-882X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： DNAマーカー情報を近交度評価に利用するため,3世代にわたる実験家系を用いて,親(P)世代におけるマーカー遺伝子型の組み合わせが雑種第2(F₂)世代のホモ型マーカー割合(マーカー近交度)に与える影響を検討した。71頭のF₂世代においてゲノム全体に分布する364個のマーカーによるマーカー近交度は0.404±0.059(平均±標準偏差)であった。P世代におけるマーカー遺伝子型の組み合わせにおける平均マーカー近交度は,AA×ABが0.574,AA×BBが0.521,AA×BCが0.376,AB×ABが0.514,AB×ACが0.382およびAB×CDが0.239であった。また,マーカー近交度の頻度分布は二項分布により算出した期待値の分布と差がなかった。さらに,全マーカーを用いたマーカー近交度とP世代におけるマーカー遺伝子型の組み合わせにより分類したマーカー近交度との間の相関係数を算出した結果,AA×BC(相関係数0.81),AB×CD(同0.74)およびAB×AC(同0.68)の組み合わせで大きかった。以上のことから,マーカー近交度は新たな近交度の指標となり得ると考えられた。ただし,マーカー情報を利用した近交度の評価においてはマーカーの持つ情報量が評価値に影響することから,マイクロサテライトマーカーのように対立遺伝子数が多く,多型の程度の高いマーカーを選択する必要があることが示された。(著者抄録)

シソーラス用語： *ブタ ,  *同系交配 ,  *DNAマーカー ,  家系 ,  系図 ,  バイオマーカー ,  雑種 ,  *遺伝子型 ,  遺伝子多型 ,  家畜育種
準シソーラス用語： マイクロサテライトマーカー ,  遺伝子マーカ ,  家系分析 ,  *近交 ,  雑種第2代

分類 (2件)： 豚  (FD02040U) ,  飼育動物の育種  (FD01020R)

引用文献 (22件)：

• ALVES, E., C. BARRAGÁN and M.A. TORO:2008, Inbreeding and homozygosity in Iberian pigs, Spanish J. Agr. Res., 6, 248-251.
• BALLOUX, F., W. AMOS and T. COULSON:2004, Does heterozygosity estimate inbreeding in real population?, Mol. Ecol., 13, 3021-3031.
• BAUMUNG, R. and J. SÖLKNER:2003, Pedigree and marker information requirements to monitor genetic variability, Genet. Sel. Evol., 35, 369-383.
• CAROTHERS, A.D., I. RUDAN, I. KOLCIC, O. POLASEK, C. HAYWARD, A.F. WRIGHT, H.CAMPBELL, P. TEAGUE, N.D. HASTIE and J.L. WEBER:2006, Estimating human inbreeding coefficients:Comparison of genealogical and marker heterozygosity approaches, Ann. Hum. Genet., 70, 666-676.
• CHAKRABORTY, R.:1981, The distribution of the number of heterozygous loci in an individual in natural populations, Genetics, 98, 461-466.

タイトルに関連する用語 (5件)： 実験 ,  家系 ,  DNAマーカー ,  近交 ,  ばらつき