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J-GLOBAL ID：201402289661590000   整理番号：13A0608461

southern flounder,Paralichthys lethostigma由来のマイクロサテライトDNAマーカーの単離と遺伝的構造分析におけるその適用

Isolation of microsatellite DNA markers from southern flounder, Paralichthys lethostigma,and its application in genetic structure analysis

著者 (7件)： Liu Zhichao (Coll. of Marine Life Sci., Ocean Univ. of China, Qingdao) ,  Liao Meijie (Qingdao Key Lab. for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Yellow Sea Fisheries Res. Inst., Chinese Acad. of ...) ,  Xu Yongjiang (Qingdao Key Lab. for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Yellow Sea Fisheries Res. Inst., Chinese Acad. of ...) ,  Liu Xuezhou (Qingdao Key Lab. for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Yellow Sea Fisheries Res. Inst., Chinese Acad. of ...) ,  Wang Yingeng (Qingdao Key Lab. for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Yellow Sea Fisheries Res. Inst., Chinese Acad. of ...) ,  Zhang Zheng (Qingdao Key Lab. for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Yellow Sea Fisheries Res. Inst., Chinese Acad. of ...) ,  Liu Yang (Qingdao Key Lab. for Marine Fish Breeding and Biotechnology, Yellow Sea Fisheries Res. Inst., Chinese Acad. of ...)
資料名： Yuye Kexue Jinzhan  (Yuye Kexue Jinzhan)
巻： 33  号： 1  ページ： 40-46  発行年： 2012年 
JST資料番号： C2028A  ISSN： 1000-7075  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 遺伝的多様性と集団構造のレベルを評価するため,southern flounder Paralichthys lethostigmaから繰り返し強化ゲノムライブラリを構築した。最初のバッチにおいて,45の陽性クローンを成功裏に配列決定し,43配列が反復モチーフを含有すると認められた。Weber(1990)分類規則に従い,配列を3カテゴリに分割した:CAまたはGAジヌクレオチドの測定において分断のない26の完全反復配列(60.5%),反復測定において1以上の分断のある14の不完全反復配列(32.6%),および異なる配列の隣接縦列単純反復のある3つの複合反復配列(6.9%)。マイクロサテライトプライマーの14対を選択し,米国由来のsouthern flounderの野生および養殖集団の多型と遺伝的構造の分析に使用した。結果は以下を示した:2つの遺伝子座は単一型で12の遺伝子座は多型であり,うち7遺伝子座はPIC値による判定で高い多型レベルを示した(PIC>0.5)。12多型座の観測および予測されたヘテロ接合性の平均は各々0.36および0.57だった。加えて,全90アレル(50有効アレル)が全サンプルの12遺伝子座において検出された。Hardy-Weinberg平衡(HWE)分析は,2集団において異なる程度で9遺伝子座が遺伝的平衡から逸脱し,全サンプルにおいてヘテロ接合体欠失が発生した(Fis>0)ことを示した。野生集団における遺伝的多様性のレベルは,養殖集団のそれよりも有意に高く,2集団の間の遺伝的距離は0.1115で,2集団の間の遺伝的差異は非常に小さいことを示唆した。本研究において12の多型マイクロサテライトを同定し,これらのマイクロサテライト遺伝子座は遺伝的多様性の分析と,southern flounderの遺伝資源の保護に役立つと考えられる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST

シソーラス用語： *ヒラメ科 ,  *サテライトDNA ,  *DNAマーカー ,  *単離 ,  生物多様性 ,  遺伝子ライブラリー ,  反復配列 ,  遺伝子座 ,  遺伝資源 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： *Paralichthys lithostigma ,  southern flounder ,  ゲノムライブラリー ,  *マイクロサテライトDNA ,  *マイクロサテライトマーカー ,  *遺伝的構造 ,  遺伝的多様性 ,  *構造分析 ,  集団構造

分類 (2件)： 魚類  (FH02020K) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (6件)： Flounder ,  マイクロサテライトDNA ,  マーカー ,  単離 ,  遺伝的構造 ,  分析