資源
J-GLOBAL ID:201410003383444804
研究資源コード:NBDC00415
更新日:2012年10月01日
DBH2H: Head-to-head Gene Database
DBH2H: Head-to-head Gene Database
保有機関:
-
Shanghai Center for Bioinformation Technology
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
ゲノム/遺伝子
, 遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (2件):
配列
, 発現
生物種 (5件):
Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
, Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116)
, Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031)
, Fugu rubripes (NCBI Taxonomy ID: 31033)
概要:
ヒト、マウス、ラット、ニワトリ、トラフグのhead-to-head (h2h)遺伝子を収集したデータベースです。ヒト、マウス、ラット、ニワトリ、トラフグにおいて、h2h遺伝子のペアは転写開始点が1kb以内に存在することが知られています。H2h領域では、CpGアイランドやSNPs、転写因子結合サイトなどの配列的特徴が見出されています。さらに、h2hペア遺伝子は、発現や機能に相関性が見られます。このデータベースでは、h2h遺伝子ペアについて、プロモーター領域に存在するCpGアイランドやSNPの情報、遺伝子発現の相関、OMIMやGene Onotology、KEGG由来の機能情報を提供しています。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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