資源
J-GLOBAL ID:201410003383444804   研究資源コード:NBDC00415 更新日:2012年10月01日

DBH2H: Head-to-head Gene Database

DBH2H: Head-to-head Gene Database
保有機関:
  • Shanghai Center for Bioinformation Technology
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  発現
生物種 (5件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Fugu rubripes (NCBI Taxonomy ID: 31033)
概要:
ヒト、マウス、ラット、ニワトリ、トラフグのhead-to-head (h2h)遺伝子を収集したデータベースです。ヒト、マウス、ラット、ニワトリ、トラフグにおいて、h2h遺伝子のペアは転写開始点が1kb以内に存在することが知られています。H2h領域では、CpGアイランドやSNPs、転写因子結合サイトなどの配列的特徴が見出されています。さらに、h2hペア遺伝子は、発現や機能に相関性が見られます。このデータベースでは、h2h遺伝子ペアについて、プロモーター領域に存在するCpGアイランドやSNPの情報、遺伝子発現の相関、OMIMやGene Onotology、KEGG由来の機能情報を提供しています。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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