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J-GLOBAL ID:201410007527897553   研究資源コード:NBDC00714 更新日:2020年03月12日

TMFunction(アーカイブ): Functional Database of Membrane Proteins

TMFunction (Archive): Functional Database of Membrane Proteins
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): タンパク質
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (34件): Bacillus halodurans (NCBI Taxonomy ID: 86665) ,  Bacteriophage M13 (NCBI Taxonomy ID: 1977402) ,  Bordetella pertussis (NCBI Taxonomy ID: 520) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Carassius auratus (NCBI Taxonomy ID: 7957) ,  Clostridium botulinum (NCBI Taxonomy ID: 1491) ,  Corynebacterium diphtheriae (NCBI Taxonomy ID: 1717) ,  Cricetulus griseus (NCBI Taxonomy ID: 10029) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Emericella nidulans (NCBI Taxonomy ID: 162425) ,  Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Escherichia coli O157 (NCBI Taxonomy ID: 1045010) ,  Escherichia coli UTI89 (NCBI Taxonomy ID: 364106) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Helicobacter pylori (NCBI Taxonomy ID: 210) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Human herpesvirus 8 (NCBI Taxonomy ID: 37296) ,  Leishmania donovani (NCBI Taxonomy ID: 5661) ,  Manduca sexta (NCBI Taxonomy ID: 7130) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986) ,  Pongo pygmaeus (NCBI Taxonomy ID: 9600) ,  Pseudomonas aeruginosa (NCBI Taxonomy ID: 287) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Rhodobacter sphaeroides (NCBI Taxonomy ID: 1063) ,  Rhodopseudomonas blastica (NCBI Taxonomy ID: 1075) ,  Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) ,  Saimiri boliviensis (NCBI Taxonomy ID: 27679) ,  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium (NCBI Taxonomy ID: 90371) ,  Shigella dysenteriae (NCBI Taxonomy ID: 622) ,  Staphylococcus aureus (NCBI Taxonomy ID: 1280) ,  Vibrio parahaemolyticus (NCBI Taxonomy ID: 670) ,  Xenopus (NCBI Taxonomy ID: 8353) ,  Xenopus laevis (NCBI Taxonomy ID: 8355)
概要:
α-ヘリックスおよびβ-バレル膜タンパク質中の機能的に重要な残基についてのデータベースです。タンパク質の基本情報やアミノ酸の修飾、変異情報の他、親和性、解離定数、IC50、活性などの実験値を格納しています。実験データは文献から収集しています。Uniprot、PDB、Pubmedなど様々な公共データベースへのリンクを持ちます。

国立研究開発法人産業技術総合研究所によるオリジナルサイト (http: //tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/) の運用は終了しました。TMFunctionのデータは引き続き生命科学系データベースアーカイブよりご利用いただけます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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