資源
J-GLOBAL ID:201410008738790638   研究資源コード:NBDC00899 更新日:2017年05月07日

GlycomeDB: The carbohydrate structures metadatabase

GlycomeDB: The carbohydrate structures metadatabase
保有機関:
  • German Cancer Research Center
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): 糖質
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  化学構造
概要:
糖鎖配列の構造情報を蓄積するためのXMLベースの配列記述フォーマット(GlycoCT)を定義し、公共データベース(CFG, KEGG, KEGG, GLYCOSCIENCES.de, BCSDB and Carbbank)の全糖鎖配列をGlycoCTに変換し、アノテーションとともにデータベースに収容しました。
構造の記述方法を統一したことによって異なるデータベース間のクロスリンクが可能となり、ユーザはこのデータベースを使用することで、5つの糖鎖構造データベースの構造情報を得ることができます。
検索したい構造を画面上で簡単に作成、入力できる構造検索、部分構造検索、類似構造検索、その他、生物種別の検索ができます。
2016年にGlyTouCanデータベース(http://glytoucan.org/ )へのデータの移行に伴って、運用は終了しました。
作成機関: NBDC

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