資源
J-GLOBAL ID:201410018929481878   研究資源コード:NBDC00713 更新日:2019年03月27日

TMBETA-GENOME (アーカイブ): Annotation of Beta-Barrel Membrane Proteins in Genomic Sequences

TMBETA-GENOME (Archive): Annotation of Beta-Barrel Membrane Proteins in Genomic Sequences
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): タンパク質
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (3件): Archaea (NCBI Taxonomy ID: 2157) ,  Bacteria (NCBI Taxonomy ID: 2) ,  Eukaryota (NCBI Taxonomy ID: 2759)
概要:
TMBETA-GENOMEはゲノム配列が完了している生物種のゲノム中に含まれるβ-バレル型膜タンパク質のデータベースです。各ゲノム配列に対して、機械学習と統計手法を用いた計算が実行され、それらのアノテーション結果がデータベースに格納されていました。その他、アミノ酸配列を入力してβ-バレル型膜タンパク質の判別解析を行う「TMBETA-DISC」や「TMBETA-SVM」などのツールも提供されていました。
現在、産業技術総合研究所によるオリジナルサイトからのデータ提供は終了していますが、TMBETA-GENOMEのデータベースは引き続き生命科学系データベースアーカイブからご利用いただけます。また、ツールはMEDALSのTMBETA-DISCのページ(http://medals.jp/list/detail/162.html) に情報が掲載されています。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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