資源
J-GLOBAL ID:201410020181682560   研究資源コード:NBDC00914 更新日:2012年10月01日

PMN: Plant Metabolic Network

PMN: Plant Metabolic Network
保有機関:
  • Carnegie Institution for Science/Department of Plant Biology
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): RNA ,  タンパク質
タグ【データの種類】 (1件): 相互作用/パスウェイ
生物種 (1件): Embryophyta (NCBI Taxonomy ID: 3193)
概要:
PMNは生化学者とデータベースのコラボレーションプロジェクトであり、植物の代謝パスウエイデータベースを構築することを目標としています。

PMNで現在公開しているデータベースは、「PlantCyc」「AraCyc」「PoplarCyc」および他の植物代謝データベースのリンク集です。

「PlantCyc」はPMNの中心的存在となる包括的な植物生化学パスウエイデータベースであり、300種類以上の植物の一次代謝、二次代謝に関わる遺伝子、酵素、化合物、反応、パスウエイについての文献情報やコンピュータによる解析結果をキュレートし提供しています。

「AraCyc」はモデル植物であるシロイヌナズナの代謝パスウエイに関する情報をキュレートし提供しています。シロイヌナズナの実験データ(遺伝子発現データ、プロテオミクスデータ、メタボロミクスデータ)を代謝パスウエイマップに重ねることができます。

「PoplarCyc」はモデル樹木であるポプラとその近縁種やハイブリッド種の代謝パスウエイに関する情報をキュレートし提供しています。ポプラの実験データ(遺伝子発現データ、プロテオミクスデータ、メタボロミクスデータ)を代謝パスウエイマップに重ねることができます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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