CYORF: Cyanobacteria Gene Annotation Database

• 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター

らん藻遺伝子に関する全世界の研究者の知識を集約した「コミュニティデータベース」です。らん藻の1種であるSynechocystis sp. PCC6803 の全ゲノム配列は1996年にかずさDNA研究所により決定され、その後、配列決定時には未知であった遺伝子機能が続々と解明されました。しかしながら、その情報は学術雑誌に出版され、PubMed データベースに登録されてはいても、配列データベースに全く反映されておらず、ゲノム解析やネットワーク解析に全く利用できない状況でした。そこで、らん藻遺伝子の機能アノテーションを目的としたデータベースを構築し、らん藻DNA チップコンソーシアムのメンバーを中心に我が国の多くのらん藻研究者と共同作業を行いました。Synechocystis ゲノム中に含まれるすべての遺伝子アノテーションを見直し、その1/3にあたる約1000の遺伝子について最新の情報をもとに再アノテーションを行いました。CYORF にはかずさが決定した他のらん藻ゲノムも含まれ、今後は米国などで決定されている多くのらん藻ゲノムも追加し、各らん藻の比較解析ができるようなシステムになっています。