資源
J-GLOBAL ID:201410038048076769
研究資源コード:NBDC00182
更新日:2020年11月23日
RAP-DB: Rice Annotation Project DataBase
RAP-DB: Rice Annotation Project DataBase
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
ゲノム/遺伝子
, タンパク質
タグ【データの種類】 (1件):
配列
生物種 (1件):
Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530)
概要:
イネアノテーションプロジェクト(RAP)によるイネゲノムの高精度注釈(アノテーション)情報を収録したデータベースです。論文からのマニュアルキュレーションによりアノテーション情報を追加しています。ゲノムブラウザ(GBrowse/JBrowse)により、アノテーション情報をグラフィカルに参照できます。また、ユーザー自身の配列とイネゲノム配列の類似性検索(BLAST/BLAT)を行うことができます。さらに、ゲノムブラウザTASUKE+により、500品種以上のイネのゲノムワイドな多型情報を閲覧することができます。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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