資源
J-GLOBAL ID:201410048828537712   研究資源コード:NBDC00371 更新日:2019年03月27日

ASTRA (アーカイブ): Alternative Splicing and Transcription Archives

ASTRA (Archive): Alternative Splicing and Transcription Archives
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  cDNA/EST
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (6件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)
概要:
ASTRAは、ヒト、マウス、ハエ、線虫、シロイヌナズナ、イネについて、選択的スプライシングと選択的転写開始のパターンを収集したデータベースです。独自のアルゴリズムを用いて、ゲノム塩基配列とcDNA配列のマッピング結果から得られるエキソン-イントロン構造から、カセット型、5'end型等の種々の選択的スプライシングと選択的転写開始のパターンを検出し、分類しています。
国立研究開発法人産業技術総合研究所によるオリジナルサイトの運用は終了しました。引き続き生命科学系データベースアーカイブからASTRAをご利用いただけます。
作成機関: NBDC

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