資源
J-GLOBAL ID:201410052437386245   研究資源コード:NBDC01200 更新日:2015年04月30日

PCDq: Protein Complex Database with complex quality index

PCDq: Protein Complex Database with complex quality index
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): タンパク質
タグ【データの種類】 (1件): 相互作用/パスウェイ
生物種 (1件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要:
予測複合体を含めたヒト蛋白質複合体、それらの相互作用、さらにヒト蛋白質間相互作用情報のデータベースです。6つの既存の蛋白質間相互作用 (PPI)データベース (BIND、DIP、MINT、HPRD、IntActおよびGNP_Y2H)を整理統合し、それらのPPIネットワークの密な領域から蛋白質複合体を予測しました。さらに、それらを文献をもとに既知の複合体情報と照合し情報の付加や修正などの人手によるアノテーション (注釈づけ)を行いました。アノテーションの際には独自の蛋白質複合体の信頼性指標として品質管理指数 (complex quality index: CQI)を各複合体に付与しています。また複雑なネットワークを簡素に示す図を表示・編集できる機能PPI-Mapを提供しています。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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