資源
J-GLOBAL ID:201410055036714060   研究資源コード:NBDC01389 更新日:2016年12月25日

FANTOM: Functional Annotation of the Mammalian Genome

FANTOM: Functional Annotation of the Mammalian Genome
保有機関:
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): DNA ,  RNA
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  発現
生物種 (2件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
概要:
FANTOMは、ゲノムDNAから転写されているRNAの機能をカタログ化することを目的として2000年に発足した理化学研究所が主催する国際研究コンソーシアムです。これまでに第4期に渡って活動が行われており、本サイトから過去のFANTOMプロジェクトで整備されたリソースにアクセスすることができます。
第5期 (FANTOM5)では、ヒトの主要な組織、200種以上の癌細胞、30種類の細胞分化やマウス発生の経時解析用サンプル、200種以上の初代培養細胞、などから抽出したRNAについて1分子CAGE法を用いてプロモーター及びエンハンサーの活性を測定しており、CAGE ピーク領域とアノテーション、パスウェイクラスタ、エンハンサー、サンプルオントロジーなど網羅的解析により得られたリソースデータが公開されています。
作成機関: NBDC

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