資源
J-GLOBAL ID:201410058281793447   研究資源コード:NBDC01218 更新日:2017年11月27日

PmiRKB: Plant microRNA Knowledge Base

PmiRKB: Plant microRNA Knowledge Base
保有機関:
  • Zhejiang University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): 遺伝的多様性 ,  RNA
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (2件): Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530)
概要:
miRNAの4つの主要セクション (functional modules)から構成されている植物miRNA知識データベースです。対象生物はシロイヌナズナとイネです。(1) 「SNP」では、miRNA前駆体やmiRNA, 標的サイトに存在するSNP情報を提供しています。(2) 「Pri-miR」は、MPSS (Massively Parallel Signature Sequencing)データに基づく組織特異的なpri-miRNAの転写シグナル情報を提供しています。(3) 「MiR-Tar」は、PARE (Parallel Analysis of RNA Ends)データに基づく予測miRNA標的認識サイト内の開裂シグナル情報を提供しています。(4)「Seld-reg」は、PARE (Parallel Analysis of RNA Ends)データに基づくmiRNA前駆体のプロセシングとmiRNAによる自己制御の残余物シグナル情報を提供しています。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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