資源
J-GLOBAL ID:201410059224453288
研究資源コード:NBDC00733
更新日:2018年09月02日
Viral Probe Database
Viral Probe Database
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (2件):
DNA
, RNA
タグ【データの種類】 (3件):
手法
, 配列
, 生物分類
生物種 (1件):
Viruses (NCBI Taxonomy ID: 10239)
概要:
ウイルス検出方法の殆どは、特定のウイルスや良く知られている少数のウイルスのみを対象としていたり、感染力の強い新興ウイルスをカバーできないという欠点があります。そこで我々は保存配列プローブを用いて新興ウイルスや配列決定されていないウイルスを属のレベルで分類できる計算手法と、既知ウイルスを同定するための特異的プローブを開発しました。
27,610のウイルスゲノム配列(GenBank viral database (Release 152))を用いて決定した、5,700以上のウイルスに対応する属および種特異的なプローブをデータベースで提供しています。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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