資源
J-GLOBAL ID:201410059453539692   研究資源コード:NBDC01217 更新日:2012年11月22日

miRTarBase

miRTarBase
保有機関:
  • Institute of Bioinformatics and Systems Biology, National Chiao Tung University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): ゲノム/遺伝子 ,  RNA
タグ【データの種類】 (3件): 配列 ,  相互作用/パスウェイ ,  画像/動画
生物種 (14件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Bombyx mori (NCBI Taxonomy ID: 7091) ,  Xenopus laevis (NCBI Taxonomy ID: 8355) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) ,  Human herpesvirus 4 (NCBI Taxonomy ID: 10376) ,  Human herpesvirus 8 (NCBI Taxonomy ID: 37296) ,  Vesicular stomatitis Indiana virus (NCBI Taxonomy ID: 11277)
概要:
世界最大規模および最新のmiRNA-ターゲット相互作用 (miRNA-target interaction; MTI)を蓄積しているデータベースです。MTIの収集は、miRNAの機能解析研究に関する文献からテキストマイニングで自動抽出した後、手動で文献を調査しており、リポーターアッセイ、ウェスタンブロット、miRNAの過剰発現あるいはノックダウンのマイクロアレイ実験等で検証済みのものが収集されています。
現在、14生物種、669種のmiRNAと2,533件のターゲット遺伝子間の4,270件のMTIが登録されています。
作成機関: NBDC

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