資源
J-GLOBAL ID:201410065834971981   研究資源コード:NBDC00392 更新日:2018年04月30日

ChimerDB

ChimerDB
保有機関:
  • Ewha Womans University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (3件): ゲノム/遺伝子 ,  健康/疾患 ,  RNA
タグ【データの種類】 (2件): 配列 ,  書誌/ドキュメント
生物種 (1件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
概要:
ChimerDBは融合遺伝子の情報を集めたデータベースです。ChimerKB、ChimerPub、ChimerSeqの3つのモジュールで構成されています。

ChimerKBは、文献や公開されているリソースからのマニュアルキュレーションによって、実験に基づいた融合遺伝子についての、疾患との関係や配列等の知識情報を収録しています。ChimerPubは、PubMed Abstractからのテキストマイニングによって得られた融合遺伝子の情報を収録しており、テキストマイニングに基づいて要旨に注釈がつけられています。ChimerSeqは、シークエンスデータからの融合遺伝子候補を格納できるよう設計され、多様な癌患者を含むTCGAプロジェクトのRNAシーケンスデータから得られた融合遺伝子候補を収録しています。 遺伝子名、遺伝子ペア名、疾患名による検索や各種絞り込みのメニューがあります。また、データベーススキーマ、MySQLダンプファイル、エクセルフォーマットでのデータの一括ダウンロードが可能です。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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