資源
J-GLOBAL ID:201410066109774638
研究資源コード:NBDC00698
更新日:2023年09月28日
Tandem Repeats Database
Tandem Repeats Database
保有機関:
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (1件):
遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (1件):
配列
生物種 (28件):
Anopheles gambiae (NCBI Taxonomy ID: 7165)
, Apis mellifera (NCBI Taxonomy ID: 7460)
, Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)
, Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913)
, Caenorhabditis briggsae (NCBI Taxonomy ID: 6238)
, Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239)
, Corythoichthys intestinalis (NCBI Taxonomy ID: 161448)
, Canis lupus familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615)
, Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955)
, Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227)
, Drosophila mojavensis (NCBI Taxonomy ID: 7230)
, Drosophila pseudoobscura (NCBI Taxonomy ID: 7237)
, Drosophila persimilis (NCBI Taxonomy ID: 7245)
, Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 562)
, Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562)
, Fugu rubripes (NCBI Taxonomy ID: 31033)
, Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031)
, Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606)
, Oryzias latipes (NCBI Taxonomy ID: 8090)
, Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616)
, Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090)
, Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598)
, Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116)
, Rhetus (NCBI Taxonomy ID: 419719)
, Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530)
, Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932)
, Tetraodon (NCBI Taxonomy ID: 47144)
, Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)
概要:
ゲノムDNAのタンデムリピート情報を収集したデータベースです。UCSCのゲノムデータをデータソースとしています。ゲノムごとに、タンデムリピート配列、サイズ、コピー数、塩基含量%が表示されます。ユーザ自身の配列をTandem Repeats Finder(塩基配列上にある繰り返し配列を検出してくれるツール)で解析することもできます。
作成機関:
NBDC
レコード管理者:
Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件:
Creative Commons CC0 license
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