資源
J-GLOBAL ID:201410066109774638   研究資源コード:NBDC00698 更新日:2012年10月01日

Tandem Repeats Database

Tandem Repeats Database
保有機関:
  • Boston University
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): 遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (28件): Anopheles gambiae (NCBI Taxonomy ID: 7165) ,  Apis mellifera (NCBI Taxonomy ID: 7460) ,  Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) ,  Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) ,  Caenorhabditis briggsae (NCBI Taxonomy ID: 6238) ,  Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) ,  Corythoichthys intestinalis (NCBI Taxonomy ID: 161448) ,  Canis lupus familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615) ,  Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) ,  Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) ,  Drosophila mojavensis (NCBI Taxonomy ID: 7237) ,  Drosophila pseudoobscura (NCBI Taxonomy ID: 7234) ,  Drosophila persimilis (NCBI Taxonomy ID: 7245) ,  Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) ,  Fugu rubripes (NCBI Taxonomy ID: 31033) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) ,  Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Oryzias latipes (NCBI Taxonomy ID: 8090) ,  Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Rhetus (NCBI Taxonomy ID: 419719) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) ,  Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) ,  Tetraodon (NCBI Taxonomy ID: 47144) ,  Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)
概要:
ゲノムDNAのタンデムリピート情報を収集したデータベースです。UCSCのゲノムデータをデータソースとしています。ゲノムごとに、タンデムリピート配列、サイズ、コピー数、塩基含量%が表示されます。ユーザ自身の配列をTandem Repeats Finder(塩基配列上にある繰り返し配列を検出してくれるツール)で解析することもできます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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