Tandem Repeats Database

保有機関：

Boston University

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (1件)：遺伝的多様性

タグ【データの種類】 (1件)：配列

生物種 (28件)： Anopheles gambiae (NCBI Taxonomy ID: 7165) , Apis mellifera (NCBI Taxonomy ID: 7460) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702) , Bos taurus (NCBI Taxonomy ID: 9913) , Caenorhabditis briggsae (NCBI Taxonomy ID: 6238) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Corythoichthys intestinalis (NCBI Taxonomy ID: 161448) , Canis lupus familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Drosophila mojavensis (NCBI Taxonomy ID: 7230) , Drosophila pseudoobscura (NCBI Taxonomy ID: 7237) , Drosophila persimilis (NCBI Taxonomy ID: 7245) , Drosophila yakuba (NCBI Taxonomy ID: 562) , Escherichia coli (NCBI Taxonomy ID: 562) , Fugu rubripes (NCBI Taxonomy ID: 31033) , Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031) , Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Oryzias latipes (NCBI Taxonomy ID: 8090) , Monodelphis domestica (NCBI Taxonomy ID: 13616) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Pan troglodytes (NCBI Taxonomy ID: 9598) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Rhetus (NCBI Taxonomy ID: 419719) , Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) , Saccharomyces cerevisiae (NCBI Taxonomy ID: 4932) , Tetraodon (NCBI Taxonomy ID: 47144) , Xenopus tropicalis (NCBI Taxonomy ID: 8364)

概要：

ゲノムDNAのタンデムリピート情報を収集したデータベースです。UCSCのゲノムデータをデータソースとしています。ゲノムごとに、タンデムリピート配列、サイズ、コピー数、塩基含量%が表示されます。ユーザ自身の配列をTandem Repeats Finder(塩基配列上にある繰り返し配列を検出してくれるツール)で解析することもできます。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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