資源
J-GLOBAL ID:201410072619768187   研究資源コード:NBDC01325 更新日:2019年05月16日

TOT-DB: The Theileria orientalis Genome Annotation Database

TOT-DB: The Theileria orientalis Genome Annotation Database
保有機関:
  • 北海道大学 人獣共通感染症リサーチセンター
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): ゲノム/遺伝子
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (3件): Theileria orientalis (NCBI Taxonomy ID: 68886) ,  Theileria parva (NCBI Taxonomy ID: 5875) ,  Theileria annulata (NCBI Taxonomy ID: 5874)
概要:
寄生性原虫Theileria orientalisの全ゲノムを対象にしたデータベースです。G-integraプラットフォームのゲノムブラウザによって、発現データおよび遺伝子予測ソフトウェアからアノテーションされた遺伝子領域が表示されます。 病原性の強いT. parvaやT. annulataとのゲノム比較ができます。またゲノムブラウザ上で閲覧するだけではなく、BLASTによる相同性検索やデータの一括ダウンロードも行えます。全ゲノムの配列はホールゲノムショットガンと手動のギャップクロージング、自動および手動のアノテーションとを組み合わせて決定されています。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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