RIKEN Hub Database Project

保有機関：

国立研究開発法人理化学研究所横浜研究所

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , cDNA/EST

タグ【データの種類】 (1件)：発現

生物種 (4件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Caenorhabditis elegans (NCBI Taxonomy ID: 6239) , Arabidopsis thaliana (NCBI Taxonomy ID: 3702)

概要：

タイリングアレイ(遺伝子発現情報)とゲノム情報を組み合わせて統計的に解析することにより、遺伝子の構造を高い精度で推定する新しい情報処理技術を開発しました。この技術をシロイヌナズナのデータに適用し、これまでに知られている約2万7千の遺伝子領域のほかにも、約5千2百箇所の領域で発現している新たな遺伝子構造を見出し公開しています。遺伝子のネットワークや変異体の有無に関する情報もあわせて提供しています。「Forward Genetics」、「Reverse Genetics」、「Data Integration」、「Estimation of Candidate Genes」を連携させた「統合Genetics」としてのシステムであり、また、この処理を行うために独自に開発したプログラムARTADE(アートエード)の全ソースコード(プログラム内容)も公開しています。近年のゲノミクスの発展によって、膨大な量の公開データとバイオリソースの蓄積が進行しています。これらをバイオインフォマティクスによって統合化し、より効率的な原因遺伝子探索のストラテジーを作り出すことを目的としています。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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