資源
J-GLOBAL ID:201410090076425487   研究資源コード:NBDC01045 更新日:2012年10月01日

SNPSTR: A database of compound microsatellite-SNP markers

SNPSTR: A database of compound microsatellite-SNP markers
保有機関:
  • Imperial College London
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (2件): cDNA/EST ,  遺伝的多様性
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (5件): Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) ,  Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) ,  Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) ,  Canis lupus familiaris (NCBI Taxonomy ID: 9615) ,  Gallus gallus (NCBI Taxonomy ID: 9031)
概要:
マイクロサテライト(STR)マーカーと1つ以上のSNPの組み合わせのSNPSTRと呼ばれる複合遺伝マーカーのカタログです。各SNPSTRのSNPとマイクロサテライトは250塩基以内に存在しているため、2つの独立したマーカー間で生じた組み換えではなく、小さなハプロタイプと考えられます。それゆえSNPSTRは集団遺伝学分野において有用なツールになる可能性があります。
このデータベースでは、ヒト、マウス、ラット、イヌ、ニワトリの推定SNPSTRに関する情報を提供しています。
作成機関: NBDC

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