資源
J-GLOBAL ID:201410091670576718   研究資源コード:NBDC01047 更新日:2015年05月15日

TriFLDB: Triticeae Full-Length CDS Database

TriFLDB: Triticeae Full-Length CDS Database
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (1件): cDNA/EST
タグ【データの種類】 (1件): 配列
生物種 (5件): Triticum aestivum (NCBI Taxonomy ID: 4565) ,  Hordeum vulgare (NCBI Taxonomy ID: 4513) ,  Arabidopsis (NCBI Taxonomy ID: 3701) ,  Oryza sativa (NCBI Taxonomy ID: 4530) ,  Sorghum bicolor (NCBI Taxonomy ID: 4558)
概要:
コムギ連作物であるコムギとオオムギの全長コード配列とアノテーション情報を提供しています(コムギ8,530件、オオムギ7,341件)。各全長コード配列につき、様々な配列データベースに対するブラストの結果や、シロイヌナズナ、イネおよびソルガムの相同配列による階層的クラスタ結果、InterProScanによるドメインの予測結果、ESTアライメントが視覚的に表示されます。

遺伝子機能やオントロジー(GO)タームによるキーワード検索や、ユーザの配列とコムギ、オオムギ、シロイヌナズナ、イネ、ソルガムとの相同性検索が行えます。
作成機関: NBDC
レコード管理者: Integbio Database Catalog
本レコードの利用条件: Creative Commons CC0 license

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