杉田昌岳

スギタマサタケ | MASATAKE SUGITA

所属機関・部署：
職名：特任助教
ホームページURL (1件)： http://www.ritsumei.ac.jp/lifescience/bioinfo/kikuchi/index.html

研究分野 (6件)：薬系化学、創薬科学 , 生物物理学 , 構造生物化学 , 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 計算科学 , 生命、健康、医療情報学

研究キーワード (1件)：生物物理学計算科学生命情報学溶液化学統計力学理論

競争的資金等の研究課題 (5件)：

論文 (16件)：

Jianan Li, Keisuke Yanagisawa, Masatake Sugita, Takuya Fujie, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. CycPeptMPDB: A Comprehensive Database of Membrane Permeability of Cyclic Peptides. Journal of chemical information and modeling. 2023. 63. 7. 2240-2250
Masatake Sugita, Takuya Fujie, Keisuke Yanagisawa, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Lipid Composition Is Critical for Accurate Membrane Permeability Prediction of Cyclic Peptides by Molecular Dynamics Simulations. Journal of chemical information and modeling. 2022. 62. 18. 4549-4560
Masatake Sugita, Satoshi Sugiyama, Takuya Fujie, Yasushi Yoshikawa, Keisuke Yanagisawa, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Large-Scale Membrane Permeability Prediction of Cyclic Peptides Crossing a Lipid Bilayer Based on Enhanced Sampling Molecular Dynamics Simulations. Journal of Chemical Information and Modeling. 2021. 61. 7. 3681-3695
Yusei Yamada, Yoichi Ishitsuka, Yuki Kondo, Shuichi Nakahara, Asami Nishiyama, Toru Takeo, Naomi Nakagata, Keiichi Motoyama, Taishi Higashi, Hidetoshi Arima, et al. Differential mode of cholesterol inclusion with 2-hydroxypropyl-cyclodextrins increases safety margin in treatment of Niemann-Pick disease type C. British Journal of Pharmacology. 2021. 178. 13. 2727-2746
Masatake Sugita, Izumi Kuwano, Taishi Higashi, Keiichi Motoyama, Hidetoshi Arima, Fumio Hirata. Computational Screening of a Functional Cyclodextrin Derivative for Suppressing a Side Effect of Doxorubicin. The Journal of Physical Chemistry B. 2021. 125. 9. 2308-2316

MISC (1件)：

Masatake Sugita, Takeshi Kikuchi. Investigating Characteristics of Folding Cores from Analyses of Folding Mechaniams on Multi-Transition Proteins by Means of a Coarse-Grained Go Model. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2014. 106. 2. 673A-673A

特許 (1件)：

講演・口頭発表等 (32件)：

3D-RISM理論に基づいたin silico創薬基盤技術の開発
(第12回BKCバイオインフォマティクス研究会 2020)
Developing a semi analytical method for analyzing structural fluctuations of a molecule in solution phase by means of 3D-RISM theory
(The 10th TOYOTA RIKEN International Workshop on “Science of Life Phenomena Woven by Water and Biomolecules 2019)
Exploring the ligand binding mode on a fluctuating protein
(TSRC workshop: THE ROLE OF FLUCTUATIONS AND DYNAMICS IN BIOMOLECULAR FUNCTION 2019)
3D-RISM理論を応用した生体高分子の機能解析法の開発
(第1回松山道後・分子論セミナー 2018)
3D-RISM 理論を応用した溶液中における Met-enkephalin の構造揺らぎの解析
(第56回生物物理学会年会 2018)

学歴 (1件)：

学位 (1件)：

経歴 (5件)：

2021/04 - 現在東京工業大学情報理工学院特任助教
2020/01 - 2021/03 東京工業大学情報理工学院研究員
2015/05 - 2019/12 立命館大学生命科学部生命情報学科助教
2018/04 - 2018/09 University of Alberta The Department of Mechanical Engineering Invited Assistant Professor
2014/04/01 - 2015/03/30 立命館大学総合科学技術研究機構専門研究員

所属学会 (4件)：

溶液化学若手の会 , 溶液化学研究会 , 日本生物物理学会 , 日本蛋白質科学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

杉田 昌岳