村田武士

ムラタタケシ | Takeshi Murata

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： https://mprc.chiba-u.jp/m-lab/

研究分野 (2件)：構造生物化学 , 機能生物化学

研究キーワード (27件)： V-ATPase , X線結晶構造解析 , ナトリウム , モーター , 膜タンパク質 , ポンプ , Enterococcus hirae , 複合体 , 酵素反応 , 分子モーター , ATP , 計算機シミュレーション , ナノテク , 腸球菌 , 共結晶 , ナトリウムイオン , 赤血球 , X線結晶解析 , V. ATPアーゼ , イオン , バンド3 , 結晶構造解析 , 抗体 , サブユニット , 生体エネルギー , べん毛 , アニオントランスポーター

競争的資金等の研究課題 (20件)：

2023 - 2026 創薬評価技術の創出に向けたラベルフリーイオンチャネル異方性4Dセンシングへの挑戦
2023 - 2026 クライオ電顕による1分子構造解析に基づいた蛋白質構造の連続的なダイナミクスの解析
2021 - 2024 回転分子モーターのイオン輸送メカニズムの解明
2018 - 2023 発動分子を合理設計・理論計算するための物理化学評価と構造基盤の確立
2017 - 2020 回転軸のないV1モーターが一方向に回転運動する分子機構の解明

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論文 (162件)：

Masao Inoue, Tomohiko Hayashi, Satoshi Yasuda, Minoru Kato, Mitsunori Ikeguchi, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita. Statistical-Mechanics Analyses on Thermodynamics of Protein Folding Constructed by Privalov and Co-Workers. The journal of physical chemistry. B. 2024. 128. 41. 10110-10125
Yasuomi Miyashita, Toshio Moriya, Takafumi Kato, Masato Kawasaki, Satoshi Yasuda, Naruhiko Adachi, Kano Suzuki, Satoshi Ogasawara, Tetsuichiro Saito, Toshiya Senda, et al. Improved higher resolution cryo-EM structures reveal the binding modes of hERG channel inhibitors. Structure (London, England : 1993). 2024
Tomohiro Ishizuka, Kano Suzuki, Masae Konno, Keisei Shibata, Yuma Kawasaki, Hidefumi Akiyama, Takeshi Murata, Keiichi Inoue. Light-driven Anion-Pumping Rhodopsin with Unique Cytoplasmic Anion-release Mechanism. Journal of Biological Chemistry. 2024. 107797-107797
Hiroshi Ueno, Kiyoto Yasuda, Norie Hamaguchi-Suzuki, Riku Marui, Naruhiko Adachi, Toshiya Senda, Takeshi Murata, Hiroyuki Noji. Engineering of ATP synthase for enhancement of proton-to-ATP ratio. 2024
Tomohiko Hayashi, Masato Kawamura, Shunsuke Miyamoto, Satoshi Yasuda, Takeshi Murata, Masahiro Kinoshita. An accurate and rapid method for calculating hydration free energies of solutes including small organic molecules, peptides, and proteins. Journal of Molecular Liquids. 2024. 406. 124989-124989

MISC (107件)：

上野博史, 丸井里駆, 安田秩都, 安達成彦, 濱口紀江, 守屋俊夫, 川崎政人, 池田聡人, 稲葉理美, 安田賢司, et al. ATP合成酵素のペリフェラルストークの設計原理. 日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集. 2023. 49th
濱口紀江, 濱口紀江, 濱口紀江, 安達成彦, 川崎政人, 守屋俊夫, 安田賢司, 安西尚彦, 小笠原諭, 千田俊哉, et al. ATP駆動型トランスポーターP糖タンパク質の基質結合様式解明を目指したクライオ電子顕微鏡構造解析. 日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集. 2023. 49th
山下瑛理香, 中嶋萌生, 岡部勇輝, 安田賢司, 村田武士, 佐藤裕介, 佐藤裕介, 永野真吾, 永野真吾, 日野智也, et al. ヒト由来アデノシン受容体の細胞膜発現量向上を目指した部位特異的飽和変異導入とスクリーニング. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
濱口紀江, 濱口紀江, 安達成彦, 野中雄仁, 喜多俊介, 今野翔, 金岡優依, 守屋俊夫, 川崎政人, 安田賢司, et al. クライオ電子顕微鏡構造解析と高速AFM観察から見えてきたABCトランスポーター(P-gp)の構造ダイナミクス. 日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集. 2023. 23rd (CD-ROM)
川嶋大介, LI Songshi, 吉田倭, 小笠原諭, 村田武士, 武居昌宏. 電気トモグラフィ法による電位依存性イオンチャネル活性に伴う細胞外イオン濃度分布変化の可視化. 可視化情報シンポジウム(CD-ROM). 2022. 50th

特許 (19件)：

抗菌組成物及び医薬並びに抗菌方法
自由エネルギーの計算方法
アンジオテンシン変換酵素II(ACE2)に対する高親和性モノクローナル抗体
抗菌組成物及び医薬並びに抗菌方法
ナノディスクに対する高親和性抗MSPモノクローナル抗体

講演・口頭発表等 (375件)：

動物細胞を用いたヒト組み換えタンパク質の大量発現・精製系の構築とその応用例
(日本動物実験代替法学会第36回大会 2023)
Na+-Transporting V-ATPase Inhibitor Suppresses VRE Growth in Mice and Unveils Na+ Pathway Structure
(21th IPR Retreat 2023)
新規細胞内ポケットを介した class B1 GPCR の活性化機構の解明
(第61回日本生物物理学会年会 2023)
Creation of ATP synthase with multiple torque generating units
(第61回日本生物物理学会年会 2023)
高速 AFM による多剤排出トランスポーター P-gp の機能ダイナミクス解析
(第61回日本生物物理学会年会 2023)

学歴 (3件)：

1997 - 2000 東京理科大学大学院基礎工学研究科博士課程
1995 - 1997 東京理科大学大学院基礎工学研究科修士課程
1990 - 1995 東京理科大学基礎工学部生物工学科

学位 (1件)：

博士(工学) (東京理科大学)

経歴 (13件)：

2022/10 - 現在千葉大学膜タンパク質研究センターセンター長
2015/04 - 現在横浜市立大学客員教授
2014/07 - 現在千葉大学大学院理学研究院教授
2020/04 - 2022/03 高エネルギー加速器研究機構客員教授
2006/04 - 2018/12 理化学研究所客員研究員

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受賞 (11件)：

2023/12 - 生体エネルギー研究会第49回討論会若手発表賞 ATP駆動型トランスポーターP糖タンパク質の基質結合様式解明を目指したクライオ電子顕微鏡構造解析
2023/11 - 日本動物実験代替法学会第36回大会大会長特別賞動物細胞を用いたヒト組み換えタンパク質の大量発現・精製系の構築とその応用例
2023/07 - 第 4 回 MCRC 定例会最優秀発表賞多剤排出トランスポーターP 糖蛋白質 (P-gp)に対する第三世代阻害剤の阻害機序解明を目的とした立体構造解析
2022/07 - 第6回黒潮カンファレンス優秀発表賞新型コロナウイルス治療薬候補化合物が結合した多剤排出トランスポーターP糖タンパク質のクライオ電子顕微鏡単粒子解析
2022/06 - 第22回日本蛋白質科学会年会学生口頭発表賞新型コロナウイルス 3CL プロテアーゼ阻害剤が結合した P 糖タンパク質のクライオ電子顕微鏡単粒子解析

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