桜庭俊

サクラバシュン | Sakuraba Shun

所属機関・部署：
職名：主任研究員(任常)

研究分野 (2件)：生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 基礎物理化学

研究キーワード (5件)：タンパク質の合理的設計 , 自由エネルギー計算 , 構造生物学 , 生体分子 , 分子動力学

競争的資金等の研究課題 (8件)：

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論文 (46件)：

Kenji Watanabe, Tatsuro Yamamoto, Tomoko Fujita, Shinjiro Hino, Yuko Hino, Kanami Yamazaki, Yoshimi Ohashi, Shun Sakuraba, Hidetoshi Kono, Mitsuyoshi Nakao, et al. Metabolically inducing defects in DNA repair sensitizes BRCA -wild-type cancer cells to replication stress. Science Signaling. 2024. 17. 862
Masahiko Taguchi, Shun Sakuraba, Justin Chan, Hidetoshi Kono. Unveiling the Photoactivation Mechanism of BLUF Photoreceptor Protein through Hybrid Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Free-Energy Calculation. ACS Physical Chemistry Au. 2024
Junichi Higo, Kota Kasahara, Gert-Jan Bekker, Benson Ma, Shun Sakuraba, Shinji Iida, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Hidetoshi Kono, Yoshifumi Fukunishi, et al. Fly casting with ligand sliding and orientational selection supporting complex formation of a GPCR and a middle sized flexible molecule. Scientific Reports. 2022. 12. 1
Effi Haque, Aamir Salam Teeli, Dawid Winiarczyk, Masahiko Taguchi, Shun Sakuraba, Hidetoshi Kono, Paweł Leszczyński, Mariusz Pierzchała, Hiroaki Taniguchi. HNF1A POU Domain Mutations Found in Japanese Liver Cancer Patients Cause Downregulation of HNF4A Promoter Activity with Possible Disruption in Transcription Networks. Genes. 2022
Shun Sakuraba, Qilin Xie, Kota Kasahara, Junichi Iwakiri, Hidetoshi Kono. Extended ensemble simulations of a SARS-CoV-2 nsp1-5’-UTR complex. PLOS Computational Biology. 2022. 18. 1. e1009804-e1009804

MISC (2件)：

Shun Sakuraba. Comment on “Replica-exchange-with-tunneling for fast exploration of protein landscapes” [J. Chem. Phys. 143, 224102 (2015)]. The Journal of Chemical Physics. 2016. 145. 5. 057101-057101
桜庭俊, 北尾彰朗. 21pTC-6 生体分子を対象とした新規アンブレラサンプリング法の開発(化学物理一般(光応答・電子状態・シミュレーション),領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理). 日本物理学会講演概要集. 2007. 62. 1. 376-376

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

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受賞 (3件)：

所属学会 (1件)：

分子シミュレーション研究会

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桜庭 俊