桜庭俊

サクラバシュン | Sakuraba Shun

所属機関・部署：
職名：主任研究員(任常)

研究分野 (2件)：生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 基礎物理化学

研究キーワード (5件)：タンパク質の合理的設計 , 自由エネルギー計算 , 構造生物学 , 生体分子 , 分子動力学

競争的資金等の研究課題 (8件)：

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論文 (50件)：

Amarjeet Kumar, Shun Sakuraba, Nitika Gaurav, Karthik Selvam, Tatiana G. Kutateladze, Hidetoshi Kono. Mechanistic Insights into HP1α CSD Oligomerization and the Role of PxVxL Motif-Containing Proteins. Journal of Chemical Information and Modeling. 2025
Junichi Higo, Kota Kasahara, Shun Sakuraba, Gert-Jan Bekker, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Takuya Takahashi, Yoshifumi Fukunishi. A virtual system-coupled molecular dynamics simulation free from experimental knowledge on binding sites: Application to RNA-ligand binding free-energy landscape. Biophysics and Physicobiology. 2025
Kenji Watanabe, Tatsuro Yamamoto, Tomoko Fujita, Shinjiro Hino, Yuko Hino, Kanami Yamazaki, Yoshimi Ohashi, Shun Sakuraba, Hidetoshi Kono, Mitsuyoshi Nakao, et al. Metabolically inducing defects in DNA repair sensitizes BRCA -wild-type cancer cells to replication stress. Science Signaling. 2024. 17. 862
Ririka Asama, Masahiro Tominaga, Sayaka Ito, Yoichiro Ito, Kazuhiro Takemura, Shun Sakuraba, Kohei Katsurada, Nobuo Fukuda, Akihiko Kondo, Jun Ishii. Screening of protein-based inhibitors for the intracellular domain of epidermal growth factor receptor by directed evolution using the yeast Gγ recruitment system. Journal of Bioscience and Bioengineering. 2024
Masahiko Taguchi, Shun Sakuraba, Justin Chan, Hidetoshi Kono. Unveiling the Photoactivation Mechanism of BLUF Photoreceptor Protein through Hybrid Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Free-Energy Calculation. ACS Physical Chemistry Au. 2024

MISC (2件)：

Shun Sakuraba. Comment on “Replica-exchange-with-tunneling for fast exploration of protein landscapes” [J. Chem. Phys. 143, 224102 (2015)]. The Journal of Chemical Physics. 2016. 145. 5. 057101-057101
桜庭俊, 北尾彰朗. 21pTC-6 生体分子を対象とした新規アンブレラサンプリング法の開発(化学物理一般(光応答・電子状態・シミュレーション),領域12,ソフトマター物理,化学物理,生物物理). 日本物理学会講演概要集. 2007. 62. 1. 376-376

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

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受賞 (3件)：

所属学会 (1件)：

分子シミュレーション研究会

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桜庭 俊