沖真弥

オキシンヤ | OKI Shinya

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： https://oki-lab.jp

研究分野 (2件)：生命、健康、医療情報学 , 発生生物学

研究キーワード (8件)： Photo-Isolation Chemistry , 創薬医学 , バイオインフォマティクス , マウス初期発生 , 発生・分化 , 多分化能 , 再生医学 , シグナル伝達

競争的資金等の研究課題 (21件)：

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論文 (43件)：

Mengying Cui, Koji Yamano, Kenichi Yamamoto, Hitomi Yamamoto-Imoto, Satoshi Minami, Takeshi Yamamoto, Sho Matsui, Tatsuya Kaminishi, Takayuki Shima, Monami Ogura, et al. HKDC1, a target of TFEB, is essential to maintain both mitochondrial and lysosomal homeostasis, preventing cellular senescence. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2024. 121. 2
Zhaonan Zou, Yuka Yoshimura, Yoshihiro Yamanishi, Shinya Oki. Elucidating disease-associated mechanisms triggered by pollutants via the epigenetic landscape using large-scale ChIP-Seq data. Epigenetics & Chromatin. 2023. 16. 1. 34
Kazuo Miyazawa, Kaoru Ito, Masamichi Ito, Zhaonan Zou, Masayuki Kubota, Seitaro Nomura, Hiroshi Matsunaga, Satoshi Koyama, Hirotaka Ieki, Masato Akiyama, et al. Cross-ancestry genome-wide analysis of atrial fibrillation unveils disease biology and enables cardioembolic risk prediction. Nature Genetics. 2023
Zhaonan Zou, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi, Shinya Oki. Epigenetic landscape of drug responses revealed through large-scale ChIP-seq data analyses. BMC Bioinformatics. 2022. 23. 1. 51-51
Michio Iwata, Keisuke Kosai, Yuya Ono, Shinya Oki, Koshi Mimori, Yoshihiro Yamanishi. Regulome-based characterization of drug activity across the human diseasome. npj Systems Biology and Applications. 2022. 8. 1. 44-44

MISC (6件)：

鄒兆南, 沖真弥. ChIP-Atlas 〜転写制御ランドスケープの歩き方〜. JSBi Bioinformatics Review. 2023. 4. 1. 1-9
ZOU Zhaonan, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥. 投薬による遺伝子発現変動と大規模ChIP-seqデータの統合解析を駆使した薬剤作用標的となる転写因子の探索. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2021. 141st
岩田通夫, 沖真弥, 山西芳裕. 多層オミクス解析による遺伝子発現機構のディジーゾーム解析と治療薬探索. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕. パイオニア転写因子を考慮したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
鄒兆南, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥. 遺伝子発現制御に着目した薬剤摂動トランスクリプトームと大規模ChIP-seqデータの統合解析による薬剤作用ターゲット探索. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd

特許 (2件)：

書籍 (12件)：

講演・口頭発表等 (123件)：

空間的な遺伝子発現制御のしくみを探る
(学術変革領域研究(A)適応回路センサス第3回領域会議 2023)
エピゲノム統合データベース、ChIP-Atlas の使い方と使われ方
(第16回日本エピジェネティクス研究会年会 2023)
バイオのための情報学・ことはじめ
(ACT-X「生命と化学」主催:第 1 回研究者交流会議 2023)
Photo-isolation chemistry for high-resolution and deep spatial transcriptome with tissue sections
(IMGC 2023 RIKEN Symposium 2023)
光単離化学(PIC)による局所的トランスクリプトーム解析
(第100回日本生理学会大会 2023)

Works (2件)：

学歴 (3件)：

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

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委員歴 (4件)：

所属学会 (4件)：

日本メディカルAI学会 , 日本発生生物学会 , 日本分子生物学会 , 日本バイオインフォマティクス学会

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沖 真弥