研究者
J-GLOBAL ID:201501041956423540   更新日: 2024年02月01日

宮下 尚之

ミヤシタ ナオユキ | Miyashita Naoyuki
所属機関・部署:
職名: 准教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (3件):
  • 国立研究開発法人理化学研究所  生命機能科学研究センター   客員研究員
  • 国立研究開発法人理化学研究所  計算科学研究機構   客員研究員
  • 電気通信大学大学院  基盤理工学専攻   客員准教授
ホームページURL (1件): http://www2.miyashita-lab.net
研究分野 (1件): 生命、健康、医療情報学
研究キーワード (6件): AI for biophysics ,  シミュレーション ,  Molecular mechanism of Alzheimer's disease ,  replica-exchange ,  混合膜 ,  ラフト
競争的資金等の研究課題 (9件):
  • 2021 - 2024 フラビウイルス科の各ウイルスを厳密に区別できるモノクローナル抗体の開発
  • 2021 - 2024 血液凝固機能を阻害する非天然型DNAアプタマー薬剤の構造とヌクレアーゼ耐性機構
  • 2021 - 2024 分子シミュレーションを用いたアルツハイマー病におけるAβ産生の起点機構の詳細解明
  • 2019 - 2021 進化工学的および分子動力学的手法による新規ゲノム編集システムの創出 (NEDOスマートセルプロジェクト)
  • 2017 - 2020 分子シミュレーションによるアルツハイマー病初期分子機構への生体膜環境の影響解析
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論文 (58件):
  • M. Ottawa, N. Miyashita. Interaction between PET tracer and the specific residues around the gate of the open form of Monoamine Oxidase B (MAO-B). Journal of Physics: Conference Series. 2022. 2207. 012025
  • L. Matsukura, N. Miyashita. Simulation study of the function of domain swapping in the HSP90 chaperone cycle. Journal of Physics: Conference Series. 2022. 2207. 012024
  • Lisa MATSUKURA, Naoyuki MIYASHITA. Simulation Study of the Stability of Heat Shock Protein 90 (HSP90) and Co-chaperone p23 Complex. Journal of Computer Chemistry, Japan. 2021. 20. 3. 94-96
  • 和田 直樹, 村上 愛美, 丸井 和也, 宮下 尚之, 刑部 祐里子, 刑部 敬史. 新規ゲノム編集ツールTiDを用いたヒト細胞でのゲノム編集. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2021. 2021年. 103-103
  • Naoyuki Miyashita, Yasushige Yonezawa. Mutual information analysis of the dynamic correlation between side chains in proteins. The Journal of Chemical Physics. 2021. 155. 4. 044107-044107
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MISC (23件):
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講演・口頭発表等 (189件):
  • Deep Neural Networkを用いたレプリカ温度調整法の開発
    (日本物理学会2023年春季大会 2023)
  • 共有結合型ペプチド薬剤とGST二量体との相互作用機構
    (日本物理学会2023年春季大会 2023)
  • DNNベースのタンパク質モーフィング手法を用いたモノアミン酸化酵素のダイナミクス解析
    (日本物理学会2023年春季大会 2023)
  • HPCを用いたアルツハイマー病関連タンパク質γ切断酵素とコレステロールとの相互作用
    (超異分野学会東京大会2023 2023)
  • MOLECULAR DYNAMICS STUDY OF THE MECHANISM OF THE CLIENT UNFOLDED PROTEIN DELIVERY FROM HSP40 TO HSP70
    (Biophysical Society Annual Meeting BPS2023 2023)
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学歴 (3件):
  • 1999 - 2003 総合研究大学院大学 数物科学研究科 機能分子科学専攻
  • 1997 - 1999 電気通信大学大学院 電気通信学研究科 電子物性工学専攻
  • 1992 - 1997 電気通信大学 電気通信学部 電子物性工学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (総合研究大学院大学)
経歴 (16件):
  • 2018/04 - 現在 電気通信大学大学院 情報理工学研究科 基盤理工学専攻 客員准教授
  • 2018/04 - 現在 理化学研究所 生命機能科学研究センター 客員研究員
  • 2017/04 - 現在 近畿大学 生物理工学部 生命情報工学科(学科名変更) 准教授
  • 2016/04 - 現在 近畿大学大学院 生物理工学研究科 生体システム工学専攻 准教授
  • 2015/08 - 現在 理化学研究所 計算科学研究機構 客員研究員
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委員歴 (1件):
  • 2003/09 - 2005/08 日本物理学会 第54,55期 代議員
所属学会 (8件):
日本ゲノム編集学会 ,  日本物理学会 ,  日本分子生物学会 ,  アメリカ生物物理学会 ,  アメリカ化学会 ,  日本生物物理学会 ,  理論化学会 ,  日本蛋白質質科学会
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