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J-GLOBAL ID：201502202869806791   整理番号：15A1143288

メラノーマ:繊維形成性黒色腫のエキソーム塩基配列決定からNFKBIEのプロモーターに頻発する変異およびMAPK経路のさまざまな活性化変異が明らかになる

Exome sequencing of desmoplastic melanoma identifies recurrent NFKBIE promoter mutations and diverse activating mutations in the MAPK pathway

著者 (37件)： SHAIN A Hunter (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  GARRIDO Maria (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  BOTTON Thomas (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  TALEVICH Eric (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  YEH Iwei (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  GAGNON Alexander (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  BASTIAN Boris C (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  SHAIN A Hunter (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  GARRIDO Maria (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  BOTTON Thomas (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  TALEVICH Eric (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  YEH Iwei (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  ROY Ritu (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  OLSHEN Adam B (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  GAGNON Alexander (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  BASTIAN Boris C (Helen Diller Family Comprehensive Cancer Center, California, USA) ,  CHO Raymond J (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  SANBORN J Zachary (Five3 Genomics, LLC, California, USA) ,  CHUNG Jongsuk (Samsung Advanced Inst. of Technol., Seoul, KOR) ,  HUH Nam (Samsung Advanced Inst. of Technol., Seoul, KOR) ,  WANG Nicholas J (Oregon Health and Sci. Univ., Oregon, USA) ,  GRAY Joe W (Oregon Health and Sci. Univ., Oregon, USA) ,  KAKAVAND Hojabr (Melanoma Inst. Australia, New South Wales, AUS) ,  MANN Graham J (Melanoma Inst. Australia, New South Wales, AUS) ,  THOMPSON John F (Melanoma Inst. Australia, New South Wales, AUS) ,  SCOLYER Richard A (Melanoma Inst. Australia, New South Wales, AUS) ,  KAKAVAND Hojabr (Univ. Sydney, New South Wales, AUS) ,  MANN Graham J (Univ. Sydney, New South Wales, AUS) ,  THOMPSON John F (Univ. Sydney, New South Wales, AUS) ,  SCOLYER Richard A (Univ. Sydney, New South Wales, AUS) ,  THOMPSON John F (Royal Prince Alfred Hospital, New South Wales, AUS) ,  SCOLYER Richard A (Royal Prince Alfred Hospital, New South Wales, AUS) ,  WIESNER Thomas (Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  OLSHEN Adam B (Univ. California, San Francisco, California, USA) ,  HUR Joe S (Samsung Electronics Headquarters, Seoul, KOR) ,  BUSAM Klaus J (Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  MURALI Rajmohan (Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, USA)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 47  号： 10  ページ： 1194-1199  発行年： 2015年10月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 繊維形成性黒色腫は,肉腫性組織像や異なる臨床的挙動が見られる珍しいメラノーマの1つで,発症機序は分かっていない。我々は,繊維形成性黒色腫20試料について,低深度でのゲノム塩基配列決定と高深度でのエキソーム塩基配列決定を行い,次に,42症例の検証コホートにおいて293遺伝子の標的塩基配列決定を行った。繊維形成性黒色腫はその高い変異負荷(Mbあたり平均62個の変異)により,最も変異率の高いがんに位置付けられた。変異パターンから,紫外線が主要な変異誘発要因であることが強く示唆され,これは起源細胞が表面に位置することを示している。新しく同定された変化としては,14.5%の試料にNF-κB抑制因子ε(IκBε)をコードするNFKBIEのプロモーターに頻発する変異がある。メラノーマによく見られる発がん性変異,特にBRAF(p.Val600Gluをコードする)およびNRAS(p.Gln61Lysあるいはp.Gln61Argをコードする)は見られなかった。一方,MAPKやPI3Kのシグナル伝達カスケードを活性化することが知られている他の遺伝的変化が73%の試料に同定された。それらは,NF1,CBL,ERBB2,MAP2K1,MAP3K1,BRAF,EGFR,PTPN11,MET,RAC1,SOS2,NRAS,PIK3CAに影響を与える変異で,このうちのいくつかは標的療法の候補である。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *黒色腫 ,  ヒト ,  ゲノム ,  ヌクレオチド配列 ,  発癌 ,  突然変異 ,  *遺伝子 ,  プロモーター領域 ,  細胞情報伝達 ,  MAPキナーゼ
準シソーラス用語： *NFKBIE遺伝子 ,  エクソーム ,  *繊維形成性黒色腫

分類 (2件)： 遺伝的変異  (EC01030Y) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

タイトルに関連する用語 (8件)： メラノーマ ,  黒色腫 ,  エキソーム ,  塩基配列 ,  プロモーター ,  変異 ,  MAPK経路 ,  活性化