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J-GLOBAL ID：201502203270418269   整理番号：15A0803954

高処理能力の配列決定を使用する海洋バイオフィルムから真核生物集団の早期検出:異なったサンプリング装置の評価

Early detection of eukaryotic communities from marine biofilm using high-throughput sequencing: an assessment of different sampling devices

著者 (8件)： POCHON Xavier (Cawthron Inst., Nelson, NZL) ,  POCHON Xavier (Univ. Auckland, Auckland, NZL) ,  ZAIKO Anastasija (Klaipeda Univ., Klaipeda, LTU) ,  HOPKINS Grant A. (Cawthron Inst., Nelson, NZL) ,  BANKS Jonathan C. (Cawthron Inst., Nelson, NZL) ,  BANKS Jonathan C. (Univ. Waikato, Hamilton, NZL) ,  WOOD Susanna A. (Cawthron Inst., Nelson, NZL) ,  WOOD Susanna A. (Univ. Waikato, Hamilton, NZL)
資料名： Biofouling  (Biofouling)
巻： 31  号： 3-4  ページ： 241-251  発行年： 2015年03月 
JST資料番号： T0718A  ISSN： 0892-7014  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 世界の貿易および関連する海運業等の人の活動の増加により,種の伝来の速度が加速され,非固有種が,世界の海洋の生物多様性および生態系の最も重大な脅威の一つになっている。海洋バイオフィルムから真核生物集団を検出するために,4種類のサンプリング装置(改良したシリンジ,殺菌したスポンジ,水中テープおよび殺菌した綿棒)の性能を比較した。水中テープはDNA品質及びPCRステップに失敗したが,他の3種類のサンプリング装置からは,高品質の遺伝子DNAおよびHTSライブラリーが得られた。

シソーラス用語： *生物膜 ,  真核生物 ,  試料採取 ,  試料採取器 ,  ミクロフローラ ,  *遺伝学実験技術 ,  rRNA遺伝子 ,  *海洋生物 ,  *生物汚損 ,  ユウレイボヤ属
準シソーラス用語： 18SrRNA遺伝子 ,  Ciona savignyi ,  ハイスループット塩基配列決定法

分類 (2件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

タイトルに関連する用語 (7件)： 処理能力 ,  フィルム ,  真核生物 ,  集団 ,  早期 ,  サンプリング装置 ,  評価