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J-GLOBAL ID:201502203557057860   整理番号:15A0635888

半導体配列決定 いくつのフローを必要とするか?

Semiconductor sequencing: how many flows do you need?
著者 (8件):
資料名:
巻: 31  号:ページ: 1199-1203  発行年: 2015年04月15日 
JST資料番号: T0478A  ISSN: 1367-4803  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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半導体配列決定は,化学的に符号化された情報を半導体により検出される電圧信号へ変換する。各タイプのヌクレオチドに対する周期的反復フローで与えられるヌクレオチドからの鎖合成中において,反応ウェルにおけるpH値および電位の変化を検出する。ランダム塩基配列決定モデルにおいて必要とされるフローの数を計算し,蓄積分布関数,期待値および分散に対する正確な表現を示した。そのうえ,インプットとしてゲノム位置のBEDファイルを用いてアンプリコンの完全リストに必要とされるフローの数を計算するアルゴリズムを与えた。このアルゴリズムを応用して,癌研究における標的化配列決定に対し用いられるアンプリコンを網羅するに必要とされるフローの数を計算した。
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分類 (2件):
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固体デバイス一般  ,  遺伝子の構造と化学 
タイトルに関連する用語 (1件):
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