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J-GLOBAL ID：201502203663387755   整理番号：15A0695514

ゲノムシークエンシングデータのディスクベースの圧縮

Disk-based compression of data from genome sequencing

著者 (4件)： GRABOWSKI Szymon (Lodz Univ. Technol., Lodz) ,  DEOROWICZ Sebastian (Silesian Univ. Technol., Gliwice) ,  ROGUSKI Lukasz (Polish-Japanese Inst. Information Technol., Warszawa, POL) ,  ROGUSKI Lukasz (Centro Nacional de Analisis Genomico (CNAG), Barcelona, ESP)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 9  ページ： 1389-1395  発行年： 2015年05月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAシークエンスデータのオーバーラッピングリードをグルーピングし,圧縮するためのアルゴリズムORCOMについて示した。ORCOMにより2種類のヒトゲノムシークエンシングデータセットの圧縮を行ったところ,それぞれ1.005bpbおよび0.317bpbの圧縮率が得られた。これにより,後者のデータセットでは134.0Gbpのデータセットを5.31GBのスペースに保存することが可能となった。ORCOMは無償の使用許諾下で実行可能である。

シソーラス用語： ゲノム ,  遺伝学実験技術 ,  *データ圧縮 ,  *アルゴリズム ,  記憶媒体 ,  ヒト ,  圧縮率
準シソーラス用語： *DNAシークエンシング ,  DNA配列解析 ,  データセット ,  ヒトゲノム ,  *ORCOM

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (1件)： ディスク