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J-GLOBAL ID：201502204667978127   整理番号：15A1147146

新規HLA*01:130対立遺伝子の配列解析とHLA分子の3次元構造のモデル化【Powered by NICT】

Sequence analysis of a novel HLA-A * 01:130 allele and modeling of three-dimensional structure of HLA molecule

著者 (10件)： Li Xin (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Ding Juan (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Hou Ling (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Wang Xin (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Yan Tingyu (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Li Jihong (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Zhang Chunyan (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Zhao Suzhen (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Liu Ying (Blood Center of Haerbin, Harbin) ,  Liu Jie (Blood Center of Haerbin, Harbin)
資料名： Zhongguo Mianyixue Zazhi  (Zhongguo Mianyixue Zazhi)
巻： 31  号： 4  ページ： 514-516  発行年： 2015年 
JST資料番号： C2268A  ISSN： 1000-484X  CODEN： ZMZAEE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】は新規対立遺伝子HLA*01:130を確認するためと異常反応パターンのヌクレオチド配列を解析した。【方法】は試料DNAのHLAタイピングはPCR-SBTで行った。あいまいな新しいHLA対立遺伝子は一本鎖SBT手法で確認された,DNA配列解析で,新規の対立遺伝子とHLA*0166対立遺伝子の間の差を同定した。最後に,HLA分子の三次元構造にスイスモデルによりモデル化した。【結果】は新規対立遺伝子は全ての既知のHLA-A対立遺伝子配列と異なっていた。解析後,符号化変化99TyrをもたらすA→G(コドン99TAT→TGT)はCysに変更したが368位でA*01:66とは異なっていた1ヌクレオチドであった。残基99でHLAポリペプチドのアミノ酸置換は抗原ペプチド結合領域のβシートに位置していた。【結論】は対立遺伝子は,公式に世界保健機関(WHO)HLA命名法委員会によるHLA*01:130と命名された新規対立遺伝子である。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 結合部位 ,  モデリング ,  *対立遺伝子 ,  ヌクレオチド配列 ,  コドン ,  DNA【核酸】 ,  HLA-A ,  ヌクレオチド
準シソーラス用語： 抗原ペプチド ,  アミノ酸置換 ,  遺伝子配列 ,  DNA配列解析 ,  HLAタイピング ,  *三次元構造 ,  *配列解析 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  疫学  (GB03000E)

タイトルに関連する用語 (6件)： 対立遺伝子 ,  配列解析 ,  HLA ,  分子 ,  3次元構造 ,  モデル化