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J-GLOBAL ID：201502204675906240   整理番号：15A0572824

ヒトゲノム全域での変異率の変動の基盤となるDNAミスマッチ修復の差異

Differential DNA mismatch repair underlies mutation rate variation across the human genome

著者 (6件)： SUPEK Fran (Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona, ESP) ,  LEHNER Ben (Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona, ESP) ,  SUPEK Fran (Univ. Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, ESP) ,  LEHNER Ben (Univ. Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, ESP) ,  SUPEK Fran (Rudjer Boskovic Inst., Zagreb, HRV) ,  LEHNER Ben (Institutetucio Catalana de Recerca i Estudis Avancats (ICREA), Barcelona, ESP)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 521  号： 7550  ページ： 81-84  発行年： 2015年05月07日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトゲノム全域における体細胞変異率にはかなりの変動が見られ,変異率はヘテロクロマチンの複製遅延領域では上昇していて,早期複製ユークロマチンでは低下していることががんゲノムの塩基配列解読から明らかになっている。これにはさまざまな仕組みが関わっていることが示唆されてきたが,実際の原因については不明であった。今回我々は,DNAミスマッチ修復(MMR)の変動性が,こうした変異率の変動の基盤であることを明らかにする。652の腫瘍のゲノムから1700万の一塩基バリアントを解析したところ,メガ塩基レベルの分解能での局所的な常染色体の変異率はどのタイプのがんでもおおむね安定しており,差異は複製のタイミングや遺伝子発現の変化に関連していることが分かった。しかし,MMRの不活性化後に生じた変異は,早期複製ユークロマチンと比較して,複製遅延ヘテロクロマチンで濃縮することはなかった。従って,ヒトゲノム全域における大規模な局所的変異率の変動の主な原因は,変異の供給の違いではなく,DNA修復の違いにある。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *ミスマッチ修復 ,  ヒト ,  *ゲノム ,  腫瘍 ,  遺伝子発現 ,  複製【遺伝】 ,  クロマチン ,  ヘテロクロマチン ,  *突然変異 ,  一塩基多型
準シソーラス用語： SNP ,  ユークロマチン ,  *体細胞変異 ,  変異率

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒトゲノム ,  変異率 ,  基盤 ,  DNA ,  ミスマッチ修復 ,  差異