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J-GLOBAL ID：201502204813743390   整理番号：15A1267729

生体膜および関連する巨大分子集合を特性化するための効果的手法としての分子動力学シミュレーションおよび中性子反射率

Molecular Dynamics Simulations and Neutron Reflectivity as an Effective Approach To Characterize Biological Membranes and Related Macromolecular Assemblies

著者 (7件)： DARRE L. (King’s Coll. London, London, GBR) ,  IGLESIAS-FERNANDEZ J. (King’s Coll. London, London, GBR) ,  KOHLMEYER A. (Temple Univ., Pennsylvania, USA) ,  WACKLIN H. (European Spallation Source ESS AB, Lund, SWE) ,  WACKLIN H. (Lund Univ., Lund, SWE) ,  DOMENE C. (King’s Coll. London, London, GBR) ,  DOMENE C. (Univ. Oxford, Oxford, GBR)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 11  号： 10  ページ： 4875-4884  発行年： 2015年10月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 中性子反射率実験により決定された構造性質と分子動力学シミュレーションにより得られた構造性質を比較するための新規ツールを示した。このツールは分子動力学シミュレーションが実験データを再現する能力をベンチマークするが,実験的に決定された量の偏った解釈も促進する。この新しいツールの能力を説明するため,2つの応用例を示した。第1の例は,原子モデルおよび粗粒モデル両者からのデータを用いた分子動力学シミュレーションからのDMPC脂質二重膜に対する反射率プロファイルの生成および実験的測定データとの比較である。第2の例は,単一および混合DOPCおよびDPPC二重層の全原子シミュレーションからの温度および組成による脂質容積変化の計算である。

シソーラス用語： *生体膜 ,  分子 ,  高分子 ,  *分子集合体 ,  *計算機シミュレーション ,  *分子動力学 ,  *反射率 ,  *中性子反射 ,  構造特性 ,  測定データ ,  ベンチマーク ,  原子モデル ,  モデル ,  脂質二分子膜 ,  脂質 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族アルコール ,  脂肪族カルボン酸 ,  無機酸エステル ,  第四アンモニウム ,  カルボン酸エステル ,  アミノアルコール ,  ポリオール ,  ジグリセリド ,  オレフィン化合物 ,  不飽和カルボン酸 ,  脂肪酸 ,  レシチン
準シソーラス用語： 巨大分子 ,  *分子動力学シミュレーション ,  *中性子反射率 ,  構造性質 ,  実験データ ,  粗粒モデル ,  脂質二重膜 ,  全原子分子動力学シミュレーション

分類 (4件)： 生体膜一般  (EF04010G) ,  分子間相互作用  (BH07020P) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H) ,  中性子との相互作用  (BK16060O)

物質索引 (3件)： DMPC ,  DOPC ,  DPPC

タイトルに関連する用語 (6件)： 生体膜 ,  分子集合 ,  特性化 ,  手法 ,  分子動力学シミュレーション ,  中性子反射率