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J-GLOBAL ID：201502205636476472   整理番号：15A0906026

1型糖尿病:HLA-DQおよびHLA-DR分子の3つのアミノ酸部位の相加効果と交互作用効果が1型糖尿病のリスクをもたらす

Additive and interaction effects at three amino acid positions in HLA-DQ and HLA-DR molecules drive type 1 diabetes risk

著者 (24件)： HU Xinli (Brigham and Women’s Hospital, Massachusetts, USA) ,  DEUTSCH Aaron J (Brigham and Women’s Hospital, Massachusetts, USA) ,  RAYCHAUDHURI Soumya (Brigham and Women’s Hospital, Massachusetts, USA) ,  LENZ Tobias L (Brigham and Women’s Hospital, Massachusetts, USA) ,  HAN Buhm (Brigham and Women’s Hospital, Massachusetts, USA) ,  HU Xinli (Partners Center for Personalized Genetic Medicine, Massachusetts, USA) ,  DEUTSCH Aaron J (Partners Center for Personalized Genetic Medicine, Massachusetts, USA) ,  RAYCHAUDHURI Soumya (Partners Center for Personalized Genetic Medicine, Massachusetts, USA) ,  HU Xinli (Broad Inst., Massachusetts, USA) ,  DEUTSCH Aaron J (Broad Inst., Massachusetts, USA) ,  HAN Buhm (Broad Inst., Massachusetts, USA) ,  RAYCHAUDHURI Soumya (Broad Inst., Massachusetts, USA) ,  HU Xinli (Div. of Health Sci. and Technol., Harvard-MIT, Massachusetts, USA) ,  DEUTSCH Aaron J (Div. of Health Sci. and Technol., Harvard-MIT, Massachusetts, USA) ,  HU Xinli (Harvard Medical School, Massachusetts, USA) ,  LENZ Tobias L (Max Planck Inst. for Evolutionary Biology, Ploen, DEU) ,  ONENGUT-GUMUSCU Suna (Univ. Virginia, Virginia, USA) ,  CHEN Wei-Min (Univ. Virginia, Virginia, USA) ,  RICH Stephen S (Univ. Virginia, Virginia, USA) ,  HAN Buhm (Univ. Ulsan Coll. of Medicine, Seoul, KOR) ,  HOWSON Joanna M M (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  TODD John A (Univ. Cambridge, Cambridge, GBR) ,  DE BAKKER Paul I W (Univ. Medical Center Utrecht, Utrecht, NLD) ,  RAYCHAUDHURI Soumya (Univ. Manchester, Manchester, GBR)
資料名： Nature Genetics  (Nature Genetics)
巻： 47  号： 8  ページ： 898-905  発行年： 2015年08月 
JST資料番号： W0430A  ISSN： 1061-4036  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒト白血球抗原(HLA)遺伝子の多様性によって,1型糖尿病(T1D)の遺伝的リスクの半分を説明できる。このリスクの大部分は,HLA-DRやHLA-DQ分子のアミノ酸の変化が仲介しているが,大規模な連鎖不平衡があるため,個別の効果の存在部位を求めるのが複雑になっている。本論文では,このような効果を持つシグナルを,18,832の症例対照試料を用いて,HLA-DQとHLA-DRの3つのアミノ酸部位に位置づけたので報告する。HLA-DQβ1の57番目のアミノ酸(既知,P=1×10^-1,355)のみにより,全表現型分散の15.2%が説明できた。HLA-DRβ1の13番目のアミノ酸(P=1×10^-721)と71番目のアミノ酸(P=1×10^-95)でのそれぞれ独立した効果により,説明される分散の割合は26.9%に増加した。この3つのアミノ酸部位を合わせると,HLA-DRB1-HLA-DQA1-HLA-DQB1座位の表現型分散の90%が説明できた。さらに,一般的なHLA-DRB1-HLA-DQA1-HLA-DQB1のハプロタイプ21組のうち11組に有意な相互作用が観察された(P=1.6×10^-64)。HLA-DRβ1の13番目のアミノ酸と71番目のアミノ酸は,抗原結合溝のP4ポケットに関与しているので,HLA-DQ P9ポケットに加えて,T1Dのリスクに重要な別のタンパク質構造が示された。Copyright Nature Publishing Group 2015

シソーラス用語： *HLA-DQ ,  *HLA-DR ,  *1型糖尿病 ,  危険因子 ,  ヒト ,  症例対照研究 ,  アミノ酸残基 ,  アミノ酸配列 ,  表現型 ,  遺伝子座 ,  ハプロタイプ

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： 1型糖尿病 ,  HLA-DQ ,  HLA-DR ,  分子 ,  アミノ酸 ,  相加効果 ,  交互作用効果 ,  リスク