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J-GLOBAL ID：201502207664770222   整理番号：15A1248133

安定同位体プロービングを通じた定量的微生物生態学

Quantitative Microbial Ecology through Stable Isotope Probing

著者 (14件)： HUNGATE Bruce A. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  MAU Rebecca L. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  SCHWARTZ Egbert (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  CAPORASO J. Gregory (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  DIJKSTRA Paul (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  VAN GESTEL Natasja (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  KOCH Benjamin J. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  LIU Cindy M. (Translational Genomics Res. Center, Arizona, USA) ,  LIU Cindy M. (Johns Hopkins School of Medicine, Maryland, USA) ,  MCHUGH Theresa A. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  MARKS Jane C. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  MORRISSEY Ember M. (Northern Arizona Univ., Arizona, USA) ,  PRICE Lance B. (Translational Genomics Res. Center, Arizona, USA) ,  PRICE Lance B. (George Washington Univ., Washington, DC, USA)
資料名： Applied and Environmental Microbiology  (Applied and Environmental Microbiology)
巻： 81  号： 21  ページ： 7570-7581  発行年： 2015年11月 
JST資料番号： A0427A  ISSN： 0099-2240  CODEN： AEMIDF  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 安定同位体プロービングに基づく微生物コミュニティの定量的分析法を開発した。本方法は安定同位体の取込みによるDNA密度の変化を測定することで,安定同位体トレーサーを利用することなく個々の分類群のDNAの基底密度を定量する。三つの分類群(Micrococcaceae,Pseudonocardiaceae,Herpetosiphonales)を対象とした。ポンデローサマツ森林草地土壌に[¹⁸O]水あるいは[¹³C]グルコースを添加することで,本方法の検証を行った。グルコースの添加は微生物におけるDNAへの¹⁸Oの蓄積を促進したが,その量はグルコースのみを炭素源とした際の予測量よりも多かった。本方法においてGC含量の影響は確認できなかった。本方法は微生物生態の定量的分析に有用であると結論付けた。

シソーラス用語： *標識法 ,  炭素13 ,  *生態 ,  栄養素 ,  *定量的分析 ,  塩基組成 ,  DNA【核酸】 ,  酸素18 ,  取込 ,  *ミクロフローラ ,  大腸菌 ,  *草地土 ,  Micrococcaceae ,  放線菌目 ,  Eubacterium ,  rRNA遺伝子 ,  ヘキソース ,  アルドース
準シソーラス用語： 16S rRNA遺伝子 ,  Herpetosiphonales ,  Pseudonocardiaceae ,  ヘルペトシフォン目 ,  *安定同位体プロービング ,  炭素源 ,  *微生物生態 ,  *分類群

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

物質索引 (1件)： グルコース

タイトルに関連する用語 (3件)： 安定同位体プロービング ,  定量 ,  微生物生態学