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J-GLOBAL ID：201502208080257503   整理番号：15A0890916

環境モニタリング: 次世代シークエンシングデータからの珪藻指数の推定

Environmental Monitoring: Inferring the Diatom Index from Next-Generation Sequencing Data

著者 (8件)： VISCO Joana Amorim (Univ. Geneva, Geneva, CHE) ,  APOTHELOZ-PERRET-GENTIL Laure (Univ. Geneva, Geneva, CHE) ,  CORDONIER Arielle (Dep. of Environment, Transports and Agriculture, Geneva, CHE) ,  ESLING Philippe (Univ. Geneva, Geneva, CHE) ,  ESLING Philippe (Univ. Pierre et Marie Curie, Paris, FRA) ,  PILLET Loiec (Univ. Geneva, Geneva, CHE) ,  PILLET Loiec (Lab. Adaptation et Diversite en Milieu Marin, CNRS, Roscoff, FRA) ,  PAWLOWSKI Jan (Univ. Geneva, Geneva, CHE)
資料名： Environmental Science & Technology  (Environmental Science & Technology)
巻： 49  号： 13  ページ： 7597-7605  発行年： 2015年07月07日 
JST資料番号： B0839A  ISSN： 0013-936X  CODEN： ESTHA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 個生態学的価値により重み付けした形態的に特定した珪藻種の相対的豊富度による珪藻指数は水質の評価に使用されている。次世代シークエンシング(NGS)手法を使用して環境中のDNAおよびRNAサンプルを検出して,珪藻類を特定して定量する可能性を研究した。Geneva地域の27か所の河川で分析して,顕微鏡による定量法とNGSデータから計算したスイス珪藻指数を比較した。両者の珪藻指数は有意に相関し,大部分の場所が生物学的に同じ品質状態であることを示した。NGS手法が水生生態系のバイオ評価およびバイオモニタリングに定期的に適用できることを示した。

シソーラス用語： *環境モニタリング ,  水質試験 ,  *生物指標 ,  遺伝学実験技術 ,  *ヌクレオチド配列 ,  RNA【核酸】 ,  DNA【核酸】 ,  生態系 ,  河川水 ,  スイス連邦 ,  *バイオモニタリング ,  環境DNA ,  *次世代シークエンシング ,  藻類RNA ,  *珪藻植物門 ,  *環境汚染モニタリング ,  DNA配列解析 ,  水圏生態系 ,  *指数 ,  *藻類 ,  *隠花植物 ,  *監視
準シソーラス用語： *珪藻類 ,  *汚染監視 ,  DNAシークエンシング ,  Geneva ,  水質評価 ,  水生生態系 ,  比較評価

分類 (1件)： 水質調査測定一般  (SB02060X)

タイトルに関連する用語 (5件)： 環境モニタリング ,  次世代シークエンシング ,  珪藻 ,  指数 ,  推定