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J-GLOBAL ID：201502208223297013   整理番号：15A1267701

分子動力学シミュレーションにより求めた拡散係数の誤差の推定

Estimating Error in Diffusion Coefficients Derived from Molecular Dynamics Simulations

著者 (2件)： PRANAMI Gaurav (Iowa State Univ., Iowa, USA) ,  LAMM Monica H. (Iowa State Univ., Iowa, USA)
資料名： Journal of Chemical Theory and Computation  (Journal of Chemical Theory and Computation)
巻： 11  号： 10  ページ： 4586-4592  発行年： 2015年10月 
JST資料番号： W2328A  ISSN： 1549-9618  CODEN： JCTCCE  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lennard-Jones流体およびLJ流体に懸濁された高分子の拡散係数の分子動力学シミュレーションにおける誤差要因を検討した。125~1000個のLJ粒子に関する単一の分子動力学シミュレーションによる平均二乗移動(MSD)から線形回帰分析により拡散係数を求めた。MDトラジェクトリーにおけるサンプリング間隔がMSDにおよぼす影響を調べ,最適間隔および長時間のシミュレーションでも変動が無視できないことを見いだした。複数回の独立シミュレーション(MIS)から拡散係数を求めることにより,これらの問題点をかなり改善できると結論した。

シソーラス用語： *計算機シミュレーション ,  *拡散係数 ,  *予測誤差 ,  信号標本化 ,  最適化
準シソーラス用語： サンプリング【標本化】 ,  *分子動力学シミュレーション

分類 (3件)： 液体の輸送現象一般  (BL06011A) ,  物理化学一般その他  (CB01030T) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

タイトルに関連する用語 (4件)： 分子動力学シミュレーション ,  拡散係数 ,  誤差 ,  推定