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J-GLOBAL ID：201502208399148537   整理番号：15A1308845

NMR,GC-MSおよびLC-HRMSを用いた接着性哺乳動物細胞のメタボロミクス研究のための分析方法論

Analytical methodology for metabolomics study of adherent mammalian cells using NMR, GC-MS and LC-HRMS

著者 (8件)： MADJI HOUNOUM Blandine (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  BLASCO Helene (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  NADAL-DESBARATS Lydie (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  DIEME Binta (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  MONTIGNY Frederic (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  ANDRES Christian R. (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  EMOND Patrick (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA) ,  MAVEL Sylvie (Univ. Francois-Rabelais, INSERM U930 “Imagerie et Cerveau”, CHRU de Tours, 10 Bv Tonnelle, 37044, Tours, FRA)
資料名： Analytical & Bioanalytical Chemistry  (Analytical & Bioanalytical Chemistry)
巻： 407  号： 29  ページ： 8861-8872  発行年： 2015年11月 
JST資料番号： E0425B  ISSN： 1618-2642  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近では,生体組織の代謝プロフィールがメタボロミクスで得られている。本研究では,分析の最適化(急冷,抽出,および分析方法)を含む,補完的な分析技術(NMR,GC-MS,及びLC-HRMS)に基づいたフィンガープリント解析法を開発し,代謝物の広い範囲をカバーするために,接着性哺乳動物細胞(NSC-34)の分析でこのプロトコルを試験した。接着細胞の分析は急冷/抽出法に依存している。細胞内代謝物質分析において,-40°Cのメタノール急冷/二相[MeOH/CH2Cl2/H2O(3:3:2)]抽出法が信頼できる方法であることを示した(27種の代謝物質について,1H-NMR定量分析信号の52%はRSD<5%)。GC-MS法では,シリル化後2時間60°Cでオキシム化が最良の結果を得た(73のイオン種について平均RSD=6.6%)。これに対し,LC-HRMS法は細胞抽出物試料について,ESI-ポジティブ及びESI-ネガティブイオン種を,それぞれ1009及び588生成し,それらの87及び94%はRSD<20%であった。Copyright 2015 Springer-Verlag Berlin Heidelberg Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *NMR【磁気共鳴】 ,  *GC-MS分析 ,  *LC-MS分析 ,  *細胞接着 ,  *哺乳類 ,  *解析 ,  方法論 ,  生体組織 ,  代謝 ,  シリル化 ,  オキシム化 ,  ハイブリドーマ
準シソーラス用語： GC-MS ,  NMRスペクトロスコピー ,  NSC-34細胞 ,  *メタボロミクス ,  哺乳動物

分類 (3件)： 代謝一般  (EB02030C) ,  質量分析  (CC03013N) ,  有機化合物の磁気共鳴スペクトル(分子)  (BH06073K)

引用文献 (46件)：

• Patti GJ, Yanes O, Siuzdak G (2012) Innovation: metabolomics: the apogee of the omics trilogy. Nat Rev Mol Cell Biol 13(4):263-269
• Chrysanthopoulos PK, Goudar CT, Klapa MI (2010) Metabolomics for high-resolution monitoring of the cellular physiological state in cell culture engineering. Metab Eng 12:212-222
• Allen J, Davey HM, Broadhurst D, Heald JK, Rowland JJ, Oliver SG, Kell DB (2003) High-throughput classification of yeast mutants for functional genomics using metabolic footprinting. Nat Biotechnol 21:692-696
• Wang J-R, Zhang H, Yau LF, Mi J-N, Lee S, Lee KC, Hu P, Liu L, Jiang Z-H (2014) Improved sphingolipidomic approach based on ultra-high performance liquid chromatography and multiple mass spectrometries with application to cellular neurotoxicity. Anal Chem 86:5688-5696
• Winder CL, Dunn WB, Schuler S, Broadhurst D, Jarvis R, Stephens GM, Goodacre R (2008) Global metabolic profiling of Escherichia coli cultures: an evaluation of methods for quenching and extraction of intracellular metabolites. Anal Chem 80:2939-2948

タイトルに関連する用語 (7件)： NMR ,  接着性 ,  哺乳動物細胞 ,  メタボロミクス ,  研究 ,  分析 ,  方法論