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J-GLOBAL ID：201502208988235562   整理番号：15A0405775

ATPの存在及び非存在におけるIDEによるアミロイドβ42分解のQM/MMシミュレーション

QM/MM Simulations of Amyloid-β 42 Degradation by IDE in the Presence and Absence of ATP

著者 (2件)： DA CRUZ Carlos H. B. (Universidade Federal de Pernambuco, PE, BRA) ,  SEABRA G. M. (Universidade Federal de Pernambuco, PE, BRA)
資料名： Journal of Chemical Information and Modeling  (Journal of Chemical Information and Modeling)
巻： 55  号： 1  ページ： 72-83  発行年： 2015年01月 
JST資料番号： A0294A  ISSN： 1549-9596  CODEN： JCISD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： インスリン分解酵素(IDE)によるアミロイドβ42の分解におけるATPの調節機構を調べた。量子力学及び分子力学(QM/MM)シミュレーションにより,反応に対する自由エネルギーを計算した。反応は二段階で行われ,第一段階が中間体の産生,第二段階が基質のペプチド結合の分解に分かれた。第二段階が反応の律速であった。ATPの存在により反応は調節され,ATPの非存在時,活性化自由エネルギーは15±2kcal/molに対し,ATPの存在により,活性化自由エネルギーは7kcal/mol高くなった。このことは,ヌクレオチドの存在が反応速度を10⁵倍高めることを意味した。

シソーラス用語： *インスリナーゼ ,  アミロイドβタンパク質 ,  ペプチド ,  量子論 ,  分子内力学 ,  *酵素的分解 ,  自由エネルギー ,  活性化エネルギー ,  酵素反応機構 ,  律速 ,  *高エネルギーリン酸化合物 ,  計算機シミュレーション ,  アデニンヌクレオチド ,  リボヌクレオチド
準シソーラス用語： アミロイドβ42 ,  結合自由エネルギー ,  分子動力学シミュレーション

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： ATP

タイトルに関連する用語 (5件)： ATP ,  IDE ,  アミロイドβ42 ,  分解 ,  シミュレーション