文献

J-GLOBAL ID：201502209136257958   整理番号：15A0965196

小さいサンプルサイズの発現データを用いて推定された制御ネットワーク 赤血球システムにおける応用および検証

Regulatory network inferred using expression data of small sample size: application and validation in erythroid system

著者 (4件)： ZHU Fan (Univ. Michigan, MI, USA) ,  SHI Lihong (Peking Union Medical Coll., Tianjin, CHN) ,  ENGEL James Douglas (Univ. Michigan, MI, USA) ,  GUAN Yuanfang (Univ. Michigan, MI, USA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 15  ページ： 2537-2544  発行年： 2015年08月01日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの公開された時系列データセットおよび分化過程に特異的な制御ネットワークをモデル化する小さいサンプルサイズの細胞系譜特異的データを利用できるグラフィカルモデルについて述べた。まず,ネットワーク推論を用いて,個々の公開データセットにおける制御関係を予測した。ついで,細胞系譜特異的データに対する評価により,予測された指向性関係を重みづけし統合した。このアルゴリズムの精度を試験するためヒト赤血球形成中の時系列RNA配列データセットを集め,この分化過程に特異的な制御関係を推定した。

シソーラス用語： *データ ,  *遺伝子発現 ,  *ネットワーク ,  *遺伝的調節 ,  *赤血球 ,  集合 ,  モデリング ,  細胞分化 ,  胚発生 ,  推論 ,  造血 ,  遺伝学実験技術 ,  RNA【核酸】 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： RNA配列解析 ,  グラフィカルモデル ,  データセット ,  モデル化 ,  *遺伝子制御ネットワーク ,  *遺伝子発現データ ,  細胞系譜 ,  *制御ネットワーク ,  赤血球形成

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  赤血球  (EJ03020W) ,  オペレーションズリサーチ一般  (KA03010Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： サンプル ,  サイズ ,  発現 ,  推定 ,  制御ネットワーク ,  赤血球 ,  応用 ,  検証