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J-GLOBAL ID:201502209346245855   整理番号:15A1332523

コア弾力性とDNA長のチューニングを介した超分子ケージ2量体のDNA仲介集合強化:実験的-モデル使用の複合解析

Enhancing DNA-Mediated Assemblies of Supramolecular Cage Dimers through Tuning Core Flexibility and DNA Length-A Combined Experimental-Modeling Study
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巻: 137  号: 41  ページ: 13381-13388  発行年: 2015年10月21日 
JST資料番号: C0254A  ISSN: 0002-7863  CODEN: JACSAT  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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芳香族有機化合物をコアとして用いて,2個の相補的小分子DNAハイブリッド(SMDH)から超分子ケージ調製を行った。SMDH集合に対するコアの弾力性やDNA長の影響を融点測定やPAGE分析を行って実験的に調べた。一方,粗粒(CG)モデルを使って分子動力学(MD)コンピューターシミュレーションを行った。これらの実験的およびコンピューターシミュレーション結果から,集合体収量は用いた低分子コアの弾力性と,コアに結合するDNAアームの長さの影響を受けることが分かった。すなわち,コアが強固でなく,DNAアームが十分に短い時に高収率が得られた。また,これらの解析から,明確に定義されないネットワークの形成に対する影響についても推定した。
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分類 (1件):
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核酸一般 
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