文献

J-GLOBAL ID：201502209539849758   整理番号：15A1387516

Mg²⁺は,リボスイッチのリガンド媒介折畳みを誘導適合から構造選択へと遷移させる

Mg²⁺ Shifts Ligand-Mediated Folding of a Riboswitch from Induced-Fit to Conformational Selection

著者 (4件)： SUDDALA Krishna C. (Univ. Michigan, Michigan, USA) ,  WANG Jiarui (Univ. Michigan, Michigan, USA) ,  HOU Qian (Univ. Michigan, Michigan, USA) ,  WALTER Nils G. (Univ. Michigan, Michigan, USA)
資料名： Journal of the American Chemical Society  (Journal of the American Chemical Society)
巻： 137  号： 44  ページ： 14075-14083  発行年： 2015年11月11日 
JST資料番号： C0254A  ISSN： 0002-7863  CODEN： JACSAT  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Bacillus subtilisのH型シュードノットpreQ₁リボスイッチについて,Mg²⁺やリガンド結合に依存した折畳みメカニズムを,一分子FRET法により解析した。そのために,結合親和性が異なる3種類のリガンドが誘導するpreQ₁の折畳みダイナミックスを調べた。その結果,Mg²⁺の非存在下では,これらのリガンドは誘導適合メカニズムによってpreQ₁の折畳みを促進することがわかった。一方,反応速度論解析と遷移状態解析から,生理的濃度のMg²⁺が存在すると,リガンド結合前に折畳み類似構造が安定化され,リガンドの結合は構造選択メカニズムを介してpreQ₁の折畳みを促進することがわかった。しかしながら,Mg²⁺存在下でも誘導適合メカニズムと構造選択メカニズムは共存しており,その相対的な寄与度は実験条件,特にMg²⁺の濃度に依存した。これらの結果から,リボスイッチの折畳みメカニズムを研究する上で,一分子FRET法が有用であることを示唆した。

シソーラス用語： 蛍光共鳴エネルギー移動 ,  計測 ,  *mRNA ,  枯草菌 ,  二次構造 ,  RNA【核酸】 ,  結合 ,  分子 ,  *折畳み構造 ,  マグネシウム化合物 ,  金属イオン ,  濃度依存性 ,  反応速度 ,  遷移状態
準シソーラス用語： 一分子計測 ,  *リボスイッチ ,  シュードノット ,  preQ1 ,  RNAアプタマー ,  リガンド結合 ,  リガンド ,  マグネシウムイオン ,  RNA折畳み

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (5件)： リボスイッチ ,  リガンド ,  折畳み ,  誘導適合 ,  遷移