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J-GLOBAL ID：201502209982977432   整理番号：15A0790541

遺伝子型と発現データとの間の関連解析における発現量的形質遺伝子座の離散化

Discretization of Expression Quantitative Trait Loci in Association Analysis Between Genotypes and Expression Data

著者 (8件)： MASEGOSA Andres R. (Universidad de Granada, Granada, ESP) ,  ARMANANZAS Ruben (George Mason Univ., VA, USA) ,  ABAD-GRAU Maria M. (Universidad de Granada, Granada, ESP) ,  POTENCIANO Victor (Poten Dynamics, Granada, ESP) ,  MORAL Serafin (Universidad de Granada, Granada, ESP) ,  LARRANAGA Pedro (Universidad Politecnica de Madrid, Madrid, ESP) ,  BIELZA Concha (Universidad Politecnica de Madrid, Madrid, ESP) ,  MATESANZ Fuencisla (CSIC, Granada, ESP)
資料名： Current Bioinformatics  (Current Bioinformatics)
巻： 10  号： 2  ページ： 144-164  発行年： 2015年 
JST資料番号： W2353A  ISSN： 1574-8936  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 遺伝子型とmRNA転写レベルとの関連を調べるのは複雑な病気の遺伝子解析の基礎となっているが,それは単純ではなく,遺伝子転写の変化,発現量的形質遺伝子座,連鎖非平衡により病気を誘発する原因かも知れない。数値計算で解析するにもいくつかの問題があり,最も成功した関連解析は単一の多形遺伝子座のテストの際だった。研究の対象とする遺伝子にHLA-DRB5を選び,離散化のアルゴリズムを導入した。連続モデルと離散化モデルの2つの統計的なモデルに適用して,評価した。いくつかのクラス分けアルゴリズムを示し,高い予測正確性も示した。ここに,使用したソフトウェアはhttp://bios.ugr.es/DBR5に公開されている。

シソーラス用語： *遺伝子型 ,  *統計解析 ,  *量的形質遺伝子座 ,  数学的変換 ,  *遺伝子発現 ,  機械学習 ,  HLA-DR ,  表面抗原 ,  *アルゴリズム ,  遺伝的連鎖
準シソーラス用語： 連鎖 ,  HLA-DRB5 ,  マイクロアレイ遺伝子発現 ,  関連解析 ,  発現量的形質遺伝子座 ,  離散化 ,  連鎖非平衡

分類 (4件)： 遺伝学研究法  (EC01020N) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝子型 ,  発現 ,  関連解析 ,  発現量的形質遺伝子座 ,  離散化