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J-GLOBAL ID：201502210297528460   整理番号：15A0635897

特異値分解を用いたEnterobacteriaceae薬物標的の検索

Retrieval of Enterobacteriaceae drug targets using singular value decomposition

著者 (3件)： SILVERIO-MACHADO Rita (Federal Univ. Minas Gerais, MG, BRA) ,  COUTO Braulio R. G. M. (UNI-BH, MG, BRA) ,  DOS SANTOS Marcos A. (Federal Univ. Minas Gerais, MG, BRA)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 31  号： 8  ページ： 1267-1273  発行年： 2015年04月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Enterobacteriaceaeファミリーメンバーは土壌,水および植生に見出される遍在性生物であり,多くの動物の普通の腸微生物相である。本報告では,細菌薬物標的および大腸菌K12の蛋白質符号化必須遺伝子への類似性と関連した蛋白質の性質から成る生物学的濾過器と特異値分解(SVD)を組み合わせたモデルを作り,Enterobacteriaceaeファミリーにおける抗生物質薬物標的を予測した。このモデルは8つの異なる機能を示し大腸菌K12の蛋白質符号化必須遺伝子であるかまたは蛋白質符号化必須遺伝子に似ている99の薬物標的蛋白質を同定し,これらの蛋白質の活性の破壊が細胞に対し重要であることを示した。検索された候補のなかで,薬物耐性を持つ細菌からの蛋白質が見出された。

シソーラス用語： *特異値分解 ,  *腸内細菌科 ,  *ターゲット ,  *ドラッグデザイン ,  *検索 ,  土壌 ,  水 ,  植生 ,  動物 ,  腸 ,  ミクロフローラ ,  大腸菌 ,  タンパク質 ,  符号化 ,  ハウスキーピング遺伝子 ,  類似性 ,  濾過装置 ,  モデル ,  抗生物質 ,  薬物耐性
準シソーラス用語： *Enterobacteriaceae ,  大腸菌K12 ,  微生物相 ,  必須遺伝子 ,  *薬物標的 ,  濾過機

分類 (4件)： 数値計算  (JE02000J) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  製剤一般  (GY02010Z) ,  検索システム  (AC06030D)

タイトルに関連する用語 (4件)： 特異値分解 ,  Enterobacteriaceae ,  薬物標的 ,  検索